23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 57
| Base Pair (57:70)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.3* |
65.7* |
4.8* |
1.5* |
-- |
0.4 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
27.0 | 726 |
| 3 |
-- |
91.4* |
7.9* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 406 |
| B |
-- |
86.9* |
12.7* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 252 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
97.7 |
-- |
-- |
-- |
2.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 87 |
| E |
-- |
98.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.6 | 118 |
| M |
0.9* |
9.0* |
1.3* |
4.7* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
83.3 | 233 |
| |
| Base Pair (58:69)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
70.7* |
-- |
1.0* |
0.5* |
0.5 |
-- |
0.1 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
26.6 | 733 |
| 3 |
98.5* |
-- |
-- |
0.2* |
0.7 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 406 |
| B |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 252 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 94 |
| E |
94.9* |
-- |
-- |
0.8* |
2.5 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 118 |
| M |
10.3* |
-- |
3.0* |
1.3* |
0.4 |
-- |
0.4 |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
83.3 | 233 |
| |
| Base Pair (59:68)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
4.6* |
29.7* |
14.1* |
1.4* |
-- |
23.4 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
26.5 | 735 |
| 3 |
8.3* |
40.7 |
9.8 |
-- |
-- |
40.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 408 |
| B |
13.4* |
27.2 |
11.0 |
-- |
-- |
48.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 254 |
| A |
-- |
19.4 |
-- |
-- |
-- |
80.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
45.7* |
53.2* |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 94 |
| E |
-- |
76.3* |
10.2* |
-- |
-- |
12.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 118 |
| M |
-- |
3.9* |
6.0* |
4.3* |
-- |
1.7 |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
83.3 | 233 |
| |
Last generated : Mon Jul 2 2001 (16 : 9)