23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 628
| Base Pair (628:635)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
52.7* |
2.6* |
0.8* |
16.2* |
0.7 |
0.5 |
0.1 |
0.5 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
25.7 | 883 |
| 3 |
67.0* |
4.0* |
0.2* |
26.1* |
0.8 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.8 | 521 |
| B |
97.5 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 282 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
99.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
18.3* |
10.4* |
0.5* |
67.3* |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 | 202 |
| M |
6.5* |
0.8* |
2.3* |
2.7* |
0.4 |
1.5 |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.1 | 262 |
| |
| Base Pair (629:634)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
15.4* |
35.3* |
2.0* |
1.5* |
0.3 |
17.2 |
0.3 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.8 |
26.5 | 883 |
| 3 |
25.1* |
42.2* |
0.4 |
0.4 |
0.4 |
27.4 |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
1.3* |
2.0 | 521 |
| B |
21.6* |
72.3* |
-- |
0.4* |
-- |
3.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
2.2 | 282 |
| A |
97.3* |
2.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
87.0* |
3.0* |
2.0* |
-- |
7.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
16.8* |
7.4 |
1.0 |
0.5 |
1.0 |
66.3* |
1.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.5 |
2.0 | 202 |
| M |
1.9* |
1.9* |
5.0* |
3.4* |
0.4 |
0.8 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
85.5 | 262 |
| |
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