23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 637
| Base Pair (637:651) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.9* |
1.2 |
0.6* |
1.9 |
0.1 |
0.3 |
2.7 |
0.6 |
38.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.1 |
50.7 | 883 |
| 3 |
5.0* |
2.1 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
52.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
39.0 | 521 |
| B |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
97.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- | 281 |
| A |
70.3* |
29.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
1.0* |
12.0 |
-- |
1.0 |
20.0 |
5.0 |
58.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
2.0 | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 203 |
| M |
-- |
-- |
1.5* |
1.1 |
0.4* |
0.8 |
1.1 |
-- |
2.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.8 | 262 |
| |
| Base Pair (638:650)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
47.1* |
0.3* |
0.2* |
0.3* |
0.6 |
0.3 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.1 |
-- |
50.4 | 882 |
| 3 |
60.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
39.2 | 520 |
| B |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 280 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
92.0* |
-- |
2.0* |
1.0* |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 203 |
| M |
2.7* |
1.1* |
-- |
0.8* |
1.1 |
1.1 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
92.0 | 262 |
| |
| Base Pair (639:649)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.3* |
1.7 |
0.9 |
1.0* |
-- |
44.7* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
50.5 | 884 |
| 3 |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
59.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
39.5 | 522 |
| B |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
96.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
1.1 | 282 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
8.0 |
5.0 |
1.0* |
-- |
82.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
2.0 |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 203 |
| M |
1.1* |
-- |
1.1 |
3.1* |
-- |
1.9* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
92.0 | 262 |
| |
| Base Pair (640:648)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.0* |
36.6* |
8.5* |
0.7* |
0.3 |
0.5 |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.3 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
50.3 | 883 |
| 3 |
3.3* |
46.6* |
10.4* |
0.2* |
0.4 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
39.0 | 521 |
| B |
3.2* |
77.2* |
19.2* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 281 |
| A |
21.6* |
70.3* |
-- |
2.7* |
5.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
76.0* |
13.0* |
3.0* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
2.0 |
1.0 |
1.0 |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 203 |
| M |
0.4* |
1.5* |
3.1* |
0.8* |
0.4 |
0.8 |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
92.0 | 262 |
| |
| Base Pair (641:647)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
6.2 |
2.0 |
-- |
-- |
39.9* |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2* |
0.2* |
-- |
0.1 |
0.2 |
50.8 | 883 |
| 3 |
-- |
9.4 |
0.2 |
-- |
-- |
50.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
39.5 | 521 |
| B |
-- |
14.2 |
0.4 |
-- |
-- |
85.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 281 |
| A |
-- |
24.3 |
-- |
-- |
-- |
67.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
8.1 | 37 |
| C |
-- |
2.0 |
8.0 |
-- |
-- |
86.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 203 |
| M |
-- |
1.5* |
3.4* |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
0.4 |
-- |
92.7 | 262 |
| |
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