23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 76
| Base Pair (76:110)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.9* |
52.3* |
3.5* |
0.3* |
-- |
8.3 |
0.3 |
-- |
0.1 |
2.3 |
0.7 |
0.1 |
-- |
0.7 |
1.3 |
0.4 |
28.7 | 745 |
| 3 |
0.5* |
69.7* |
2.4* |
0.2* |
-- |
14.5 |
-- |
-- |
-- |
4.1 |
1.2 |
0.2 |
-- |
1.0 |
2.4 |
0.5 |
3.1 | 413 |
| B |
0.8* |
96.5* |
0.4* |
0.4* |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- | 258 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
94.9* |
4.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- | 98 |
| E |
4.2* |
2.5 |
7.6 |
-- |
-- |
48.7* |
-- |
-- |
-- |
13.4* |
-- |
0.8 |
-- |
2.5 |
7.6 |
1.7 |
10.9 | 119 |
| M |
2.1* |
3.8* |
5.1* |
0.4* |
-- |
0.9 |
0.9 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
86.0 | 234 |
| |
| Base Pair (77:109)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
7.1 |
13.7* |
37.3* |
1.9 |
0.4* |
0.4 |
0.1 |
8.6* |
-- |
-- |
0.7 |
0.3 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
29.2 | 745 |
| 3 |
12.1 |
21.8* |
42.9* |
1.2 |
0.5* |
-- |
0.2 |
15.5* |
-- |
-- |
1.2 |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
3.8 | 413 |
| B |
9.7* |
24.0* |
65.1* |
0.8* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 258 |
| A |
-- |
77.8* |
22.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
2.0* |
93.9* |
-- |
1.0* |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- | 98 |
| E |
22.7 |
2.5* |
0.8* |
3.4 |
2.5* |
-- |
-- |
53.8* |
-- |
-- |
4.2 |
1.7 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
7.5 | 119 |
| M |
1.3* |
4.3* |
3.8* |
3.8* |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
86.0 | 234 |
| |
| Base Pair (78:108)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
4.0* |
11.0 |
15.4 |
9.7* |
1.1 |
17.6* |
0.3 |
-- |
-- |
0.3* |
0.3 |
0.1 |
0.8 |
0.3 |
0.1 |
0.3 |
38.7 | 745 |
| 3 |
6.5* |
17.7 |
13.6 |
12.1* |
1.7 |
23.5* |
0.2 |
-- |
-- |
0.5* |
0.5 |
0.2 |
1.5 |
0.5 |
0.2 |
-- |
21.3 | 413 |
| B |
6.6* |
17.8 |
19.4 |
15.5* |
2.3 |
37.6* |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 258 |
| A |
2.8* |
75.0* |
16.7* |
5.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
9.2* |
54.1* |
-- |
-- |
34.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- | 98 |
| E |
11.8* |
1.7* |
10.1* |
45.4* |
15.1 |
1.7 |
1.7 |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
2.5 |
7.5 | 119 |
| M |
1.3* |
-- |
2.6* |
9.4* |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.9 | 234 |
| |
| Base Pair (79:107)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
6.7* |
37.7* |
11.0* |
2.7* |
-- |
2.8 |
6.6 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
2.7 |
0.5 |
0.7 |
0.1 |
28.2 | 745 |
| 3 |
10.9* |
47.0* |
14.0* |
2.4* |
-- |
3.9 |
11.9 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
4.8 |
1.0 |
1.2 |
0.2 |
2.2 | 413 |
| B |
9.3* |
72.1* |
12.4* |
1.9* |
-- |
3.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 258 |
| A |
58.3* |
16.7* |
11.1* |
13.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
2.0* |
86.7* |
8.2* |
2.0* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 98 |
| E |
4.2* |
1.7* |
76.5* |
-- |
0.8 |
7.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
0.8 |
0.8 |
-- |
-- |
6.7 | 119 |
| M |
1.3* |
0.9* |
6.8* |
3.4* |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.8 | 234 |
| |
| Base Pair (80:106)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
54.1* |
0.4* |
1.1* |
3.9* |
0.5 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.3 |
0.5 |
9.8 |
0.9 |
27.9 | 745 |
| 3 |
72.6* |
-- |
0.7* |
2.9* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.5 |
1.0 |
17.7 |
1.7 |
2.0 | 413 |
| B |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 258 |
| A |
91.7* |
-- |
-- |
8.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
95.9* |
-- |
1.0* |
2.0* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 98 |
| E |
67.2* |
3.4* |
3.4* |
11.8* |
3.4 |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
0.8 |
-- |
6.7 | 119 |
| M |
3.8* |
1.3* |
1.7* |
6.4* |
0.9 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.4 | 234 |
| |
| Base Pair (81:105)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
48.7* |
0.7* |
1.9* |
3.4* |
0.4 |
0.4 |
0.1 |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
43.3 | 744 |
| 3 |
65.0* |
1.0* |
1.2* |
2.7* |
0.5 |
0.2 |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
28.4 | 412 |
| B |
90.3* |
1.6* |
1.9* |
4.3* |
0.4 |
0.4 |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 257 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
85.7* |
-- |
3.1* |
7.1* |
-- |
-- |
-- |
3.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- | 98 |
| E |
-- |
-- |
0.8* |
-- |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.3 | 119 |
| M |
4.3* |
0.4* |
2.6* |
3.0* |
0.4 |
0.9 |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
87.6 | 234 |
| |
| Base Pair (82:104)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.1 |
4.3* |
0.8 |
35.6* |
1.2 |
0.1 |
0.1 |
0.1* |
0.4 |
6.2* |
-- |
3.6 |
0.8 |
2.6 |
0.3 |
43.7 | 745 |
| 3 |
-- |
0.2 |
5.1* |
-- |
40.2* |
1.9 |
-- |
0.2 |
-- |
0.7 |
10.7* |
-- |
6.3 |
1.2 |
4.6 |
-- |
28.8 | 413 |
| B |
-- |
0.4 |
8.1* |
-- |
60.9* |
2.7 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
17.1* |
-- |
2.3 |
1.9 |
5.8 |
-- |
0.4 | 258 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
25.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
8.3 |
-- |
-- |
55.6* |
-- |
11.1* |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
2.0* |
2.0 |
91.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0* |
-- |
1.0 |
1.0 |
-- |
-- |
-- | 98 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.1 | 119 |
| M |
-- |
-- |
3.8* |
1.7 |
3.8* |
0.4 |
0.4 |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
88.4 | 234 |
| |
|
| Base Pair (85:97)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
49.5* |
0.3* |
1.1* |
3.6* |
1.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
43.6 | 746 |
| 3 |
68.3* |
0.5* |
0.5* |
0.7* |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
28.8 | 413 |
| B |
96.5* |
-- |
0.8* |
1.2* |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 257 |
| A |
94.4* |
5.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
87.9* |
-- |
-- |
5.1* |
4.0 |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- | 99 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
99.2 | 120 |
| M |
-- |
-- |
2.6* |
8.1* |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
88.1 | 234 |
| |
| Base Pair (86:96)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
9.2* |
36.3* |
4.0* |
2.7* |
0.1 |
3.8 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
43.6 | 746 |
| 3 |
14.0* |
47.5* |
4.4* |
2.7* |
0.2 |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
28.8 | 413 |
| B |
12.1* |
72.8* |
7.0* |
3.9* |
0.4 |
3.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 257 |
| A |
72.2* |
25.0* |
-- |
2.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
72.7* |
7.1* |
2.0* |
-- |
17.2 |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 99 |
| E |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.2 | 120 |
| M |
4.7* |
1.3* |
2.1* |
3.0* |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
88.1 | 234 |
| |
| Base Pair (87:95)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.0* |
10.1* |
38.3* |
2.9* |
-- |
0.5 |
0.3 |
0.4 |
-- |
0.1 |
0.3 |
0.1 |
-- |
-- |
0.7 |
0.1 |
44.1 | 746 |
| 3 |
1.9* |
17.4* |
46.2* |
2.4* |
-- |
0.5 |
-- |
0.7 |
-- |
0.2 |
0.5 |
0.2 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
29.0 | 413 |
| B |
2.7* |
16.3* |
74.3* |
2.7* |
-- |
0.8 |
-- |
1.2 |
-- |
0.4 |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 | 257 |
| A |
-- |
83.3* |
-- |
8.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.8 |
-- |
-- |
-- |
5.6* |
-- |
-- | 36 |
| C |
2.0* |
1.0* |
90.9* |
2.0* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
1.0 |
-- | 99 |
| E |
0.8 |
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99.2 | 120 |
| M |
2.1* |
0.9* |
2.1* |
4.3* |
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0.4 |
0.9 |
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89.3 | 234 |
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