23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 777


Base Pair (777:787)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 57.3* 0.4* 1.2* 8.4* 24.7 -- 1.1 5.7 -- 0.1 -- -- -- -- 0.2 1.1 --847
3 51.2* -- -- 9.9* 38.8 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --484
B 81.0* -- -- 10.7* 8.3 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --242
A 97.3* -- -- 2.7* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C 98.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.0* --100
E 7.8 -- -- 10.2 82.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --205
M 52.9* 1.1* 3.8* 8.7* 8.0 -- 3.4 18.3 -- 0.4 -- -- -- -- 0.8 2.7 --263
 
Base Pair (778:786)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 94.9* 0.1* 0.2* 2.0* 0.8 0.1 0.1 0.1 -- -- 0.1 -- -- -- -- 1.2 0.2846
3 99.2 -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- 0.4483
B 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --242
A 97.3 -- -- -- 2.7 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --37
C 97.0* 1.0* -- 2.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --100
E 98.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.5 -- -- -- -- -- 1.0204
M 86.3* -- 0.8* 5.7* 2.3 0.4 0.4 0.4 -- -- -- -- -- -- -- 3.8 --263
 
Base Pair (779:785)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.9 10.7 9.7* -- 47.1* -- -- -- 28.0* -- 0.1 -- -- -- 3.0 0.4845
3 -- 0.2 0.8 7.7* -- 42.9* -- -- -- 43.8* -- 0.2 -- -- -- 3.9 0.4482
B -- -- -- 15.4* -- 77.1* -- -- -- -- -- -- -- -- -- 7.1 0.4240
A -- -- 8.1 -- -- 56.8* -- -- -- 29.7* -- -- -- -- -- 5.4 --37
C -- -- 13.0 42.0* -- 42.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- 3.0 --100
E -- 0.5 0.5 -- -- 0.5* -- -- -- 97.6* -- 0.5 -- -- -- -- 0.5205
M -- 2.7 27.8 1.1* -- 56.7* -- -- -- 9.9* -- -- -- -- -- 1.1 0.8263
 

Last generated : Mon Jul 2 2001 (16 : 9)