23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 812
Base Pair (812:1195)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
15.1* |
62.3* |
11.5* |
6.3* |
1.2 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
0.4 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
1.5 | 819 |
3 |
0.4* |
87.9* |
8.3* |
1.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 456 |
B |
-- |
98.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 237 |
A |
-- |
91.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
8.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
C |
-- |
99.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
E |
1.1* |
73.6* |
20.9* |
4.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 182 |
M |
46.4* |
3.8* |
20.9* |
16.7* |
3.8 |
0.8 |
0.4 |
0.4 |
0.4 |
0.4 |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
1.5 |
3.8 | 263 |
|
Base Pair (813:1194)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
0.6* |
33.7* |
59.0* |
2.4* |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
2.3 | 821 |
3 |
-- |
43.9* |
52.6* |
3.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 458 |
B |
-- |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 238 |
A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
C |
-- |
-- |
99.0 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
E |
-- |
89.6* |
2.7* |
7.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 183 |
M |
1.9* |
28.9* |
54.8* |
2.3* |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
1.5 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
6.4 | 263 |
|
Base Pair (814:1193)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
0.4* |
80.0* |
14.9* |
2.2* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.6 |
1.4 | 821 |
3 |
0.7* |
80.3* |
15.7* |
2.8* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 458 |
B |
-- |
99.2* |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 238 |
A |
2.7* |
62.2* |
5.4* |
29.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
C |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
E |
1.1* |
59.6* |
38.3* |
0.5* |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 183 |
M |
-- |
71.9* |
19.0* |
1.9* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
1.9 |
4.2 | 263 |
|
Base Pair (815:1192)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
7.3* |
45.3* |
41.3* |
3.0* |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.5 |
1.4 | 821 |
3 |
12.7* |
32.8* |
49.3* |
3.7* |
-- |
0.7 |
0.2 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 458 |
B |
2.1* |
53.4* |
42.9* |
0.4* |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 238 |
A |
18.9* |
56.8* |
-- |
24.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
C |
-- |
94.0* |
6.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
E |
25.1* |
1.1* |
67.8* |
3.8* |
-- |
0.5 |
0.5 |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 183 |
M |
0.8* |
48.7* |
40.7* |
3.0* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
1.5 |
4.2 | 263 |
|
Base Pair (816:1191)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
15.1* |
57.9* |
7.7* |
15.9* |
0.5 |
0.5 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.5 |
1.3 | 820 |
3 |
5.5* |
82.9* |
10.7* |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 457 |
B |
8.9* |
78.5* |
11.4* |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 237 |
A |
-- |
86.5* |
10.8* |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
C |
-- |
94.0* |
6.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
E |
2.2* |
88.0* |
9.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 183 |
M |
37.6* |
0.8* |
3.0* |
49.4* |
1.5 |
0.4 |
0.4 |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
1.5 |
3.8 | 263 |
|
Base Pair (817:1190)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
6.1* |
73.4* |
3.2* |
12.8* |
0.4 |
0.4 |
1.1 |
0.5 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.4 |
1.3 | 831 |
3 |
-- |
99.1* |
0.4* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 468 |
B |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 237 |
A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
C |
-- |
98.0* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
E |
-- |
98.5* |
1.0* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 194 |
M |
19.4* |
18.3* |
8.7* |
40.3* |
1.1 |
0.8 |
3.4 |
1.5 |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
1.1 |
3.8 | 263 |
|
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