23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 976
| Base Pair (976:987)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
48.5* |
18.6* |
3.3* |
21.8* |
-- |
-- |
0.2 |
0.5 |
0.1 |
-- |
0.1 |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
1.6 |
3.8 | 861 |
| 3 |
55.7* |
31.5* |
3.9* |
8.2* |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 485 |
| B |
98.8* |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 240 |
| A |
91.7* |
5.6* |
2.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
71.3* |
8.6* |
19.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 209 |
| M |
17.4* |
2.5* |
3.3* |
53.6* |
-- |
-- |
0.7 |
1.1 |
0.4 |
-- |
-- |
4.3 |
-- |
-- |
-- |
5.1 |
11.6 | 276 |
| |
| Base Pair (977:986)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
92.4* |
0.1* |
0.2* |
2.1* |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
4.3 | 864 |
| 3 |
98.2* |
-- |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 488 |
| B |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 243 |
| A |
91.7* |
-- |
-- |
8.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
97.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9 | 209 |
| M |
79.3* |
0.4* |
0.7* |
5.4* |
0.4 |
-- |
0.4 |
0.4 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
11.6 | 276 |
| |
| Base Pair (978:985)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
89.9* |
-- |
0.7* |
3.0* |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.9 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.2 |
4.2 | 865 |
| 3 |
98.2* |
-- |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 489 |
| B |
97.9* |
-- |
-- |
1.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 243 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
98.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 210 |
| M |
71.7* |
-- |
2.2* |
8.3* |
-- |
0.4 |
0.4 |
2.9 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
0.7 |
12.0 | 276 |
| |
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