23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 1164

Base Pair (1164:1185)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 41 47 42 0.95 0.98 0.99 1.98 0.99 0.99 -0.71 -0.69 0.02 0.61 871
3 25 29 27 1.00 0.99 0.99 1.98 0.99 1.00 0.28 0.29 0.00 0.78 495
B 16 19 16 0.91 0.99 1.00 1.99 1.00 1.00 0.47 0.51 0.00 0.79 262
A 5 5 4 0.80 0.90 0.95 1.85 0.95 0.95 0.37 0.27 0.00 0.90 37
C 8 8 8 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.83 0.83 0.00 0.97 100
E 4 5 7 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.49 1.49 0.00 0.74 196
M 8 10 7 0.78 0.89 0.94 1.83 0.94 0.94 -0.65 -0.77 0.05 0.15 276
 
Base Pair (1165:1184)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 40 43 25 0.60 0.53 0.69 1.22 0.73 0.99 -0.79 -0.68 0.02 0.60 871
3 25 29 12 0.44 0.57 0.67 1.23 0.66 1.00 -0.03 0.09 0.00 0.78 495
B 13 16 6 0.41 0.41 0.64 1.05 0.61 1.00 0.38 0.54 0.00 0.79 262
A 2 3 1 0.40 0.77 0.92 1.69 0.92 1.00 1.03 0.75 0.00 0.90 37
C 8 8 7 0.88 0.60 0.96 1.56 0.96 0.98 1.44 1.34 0.01 0.96 100
E 10 10 5 0.50 0.46 0.70 1.16 0.67 0.99 0.71 0.58 0.00 0.73 196
M 7 6 6 0.92 0.96 0.97 1.93 0.97 0.97 -0.55 -0.62 0.06 0.12 276
 
Base Pair (1166:1183)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 44 47 37 0.81 0.81 0.92 1.73 0.92 0.96 -0.49 -0.53 0.01 0.59 866
3 32 32 28 0.88 0.82 0.93 1.75 0.93 0.96 0.42 0.29 0.00 0.76 490
B 21 22 18 0.84 0.78 0.90 1.68 0.90 0.95 0.35 0.17 0.00 0.79 261
A 4 3 3 0.86 0.94 0.97 1.91 0.97 1.00 0.60 0.11 0.05 0.85 37
C 6 9 4 0.53 0.53 0.92 1.45 0.92 0.95 1.08 0.90 0.01 0.93 100
E 7 7 7 1.00 0.83 0.96 1.79 0.96 0.96 0.89 0.84 0.00 0.72 192
M 6 6 5 0.83 0.85 0.91 1.76 0.91 0.93 -0.61 -0.69 0.04 0.14 276
 
Base Pair (1167:1182)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 66 68 54 0.81 0.91 0.94 1.85 0.94 0.98 -0.79 -0.78 0.01 0.59 870
3 46 48 39 0.83 0.91 0.95 1.86 0.95 0.98 0.07 0.05 0.00 0.77 494
B 29 30 21 0.71 0.86 0.91 1.78 0.91 0.97 0.04 0.01 0.00 0.79 261
A 5 5 5 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.45 0.27 0.02 0.88 37
C 14 15 11 0.76 0.89 0.93 1.83 0.93 0.98 -0.21 -0.24 0.00 0.88 100
E 12 13 13 1.00 0.96 0.98 1.94 0.98 0.99 0.44 0.43 0.00 0.73 196
M 6 5 4 0.73 0.81 0.87 1.68 0.87 0.90 -0.58 -0.62 0.03 0.12 276
 
Base Pair (1168:1181)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 64 70 49 0.73 0.81 0.87 1.69 0.87 0.96 -0.80 -0.81 0.00 0.58 872
3 45 44 36 0.81 0.84 0.89 1.73 0.89 0.96 -0.02 -0.05 0.01 0.76 496
B 29 30 25 0.85 0.82 0.88 1.70 0.88 0.98 -0.06 -0.10 0.01 0.78 263
A 2 1 1 0.67 0.82 0.94 1.76 0.94 1.00 0.88 0.51 0.02 0.88 37
C 13 20 8 0.48 0.52 0.73 1.25 0.73 0.95 0.11 -0.11 0.00 0.90 100
E 14 13 10 0.74 0.83 0.90 1.72 0.90 0.92 0.28 0.35 0.00 0.73 196
M 6 6 5 0.83 0.94 0.97 1.91 0.97 0.97 -0.53 -0.55 0.02 0.12 276
 
Base Pair (1169:1180)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 68 66 57 0.85 0.85 0.89 1.73 0.89 0.96 -0.93 -0.91 0.00 0.54 872
3 49 46 41 0.86 0.85 0.89 1.74 0.89 0.98 -0.29 -0.29 0.00 0.74 496
B 30 24 23 0.85 0.90 0.93 1.83 0.93 0.98 -0.26 -0.29 0.01 0.75 263
A 5 5 7 1.00 0.91 0.95 1.85 0.95 1.00 0.21 0.17 0.00 0.90 37
C 15 17 13 0.81 0.78 0.84 1.62 0.84 0.87 -0.77 -0.76 0.00 0.69 100
E 14 17 11 0.71 0.71 0.83 1.54 0.83 0.97 -0.09 -0.10 0.00 0.70 196
M 4 3 3 0.86 0.75 0.88 1.62 0.88 0.88 -0.43 -0.44 0.01 0.10 276
 
Base Pair (1170:1179)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 58 60 51 0.86 0.89 0.92 1.81 0.92 0.96 -0.97 -0.96 0.00 0.48 870
3 41 44 36 0.85 0.88 0.92 1.80 0.92 0.97 -0.54 -0.52 0.00 0.67 494
B 23 24 23 0.98 0.90 0.94 1.84 0.94 0.98 -0.51 -0.45 0.00 0.65 264
A 4 4 4 1.00 0.79 0.90 1.68 0.90 1.00 -0.37 -0.49 0.02 0.71 37
C 14 13 13 0.96 0.89 0.95 1.84 0.95 0.95 -0.82 -0.81 0.01 0.54 100
E 14 16 9 0.60 0.77 0.89 1.66 0.89 0.95 -0.06 -0.10 0.00 0.68 193
M 3 3 2 0.67 0.89 0.93 1.82 0.93 0.93 -0.48 -0.50 0.01 0.09 276
 
Base Pair (1171:1178)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 43 43 32 0.74 0.84 0.90 1.74 0.90 0.95 -0.95 -0.95 0.01 0.39 871
3 36 32 25 0.73 0.86 0.92 1.78 0.92 0.96 -0.76 -0.74 0.01 0.54 495
B 22 17 16 0.82 0.88 0.92 1.79 0.92 0.98 -0.96 -0.96 0.00 0.42 263
A 5 5 2 0.40 0.56 0.77 1.34 0.77 0.84 -0.19 -0.48 0.00 0.76 37
C 7 10 7 0.82 0.77 0.86 1.63 0.86 0.93 -0.90 -0.94 0.00 0.41 100
E 9 10 7 0.74 0.83 0.94 1.78 0.94 0.97 0.31 0.54 0.02 0.67 195
M 0 1 0 0.00 0.59 0.71 1.30 0.71 0.83 -0.41 -0.46 0.01 0.08 276
 
Base Pair (1172:1177)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 25 23 18 0.75 0.69 0.83 1.52 0.83 0.98 -0.84 -0.79 0.00 0.30 873
3 23 20 16 0.74 0.63 0.83 1.46 0.83 0.99 -0.77 -0.65 0.01 0.43 497
B 9 7 7 0.88 0.82 0.92 1.75 0.92 0.99 -0.82 -0.77 0.01 0.27 264
A 3 3 3 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.57 -0.57 0.00 0.49 37
C 2 3 2 0.80 0.88 0.95 1.82 0.95 1.00 -0.57 -0.66 0.02 0.19 100
E 11 10 6 0.57 0.49 0.76 1.25 0.76 0.99 -0.18 0.06 0.00 0.63 196
M 0 0 0 0.00 0.33 0.79 1.12 0.79 0.79 -0.33 -0.27 0.00 0.06 276
 
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