23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 121


Base Pair (121:130)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 18 22 14 0.70 0.63 0.90 1.53 0.90 0.98 -0.06 -0.16 0.01 0.51 753
3 4 8 3 0.50 0.07 0.00 0.07 0.90 0.98 1.56 1.21 0.01 0.64 420
B 2 3 1 0.40 0.09 0.00 0.09 0.96 0.99 1.87 1.66 0.01 0.80 264
A 1 3 1 0.50 0.06 0.00 0.06 0.44 0.97 1.59 0.87 0.00 0.88 36
C 9 8 6 0.71 0.61 0.90 1.51 0.90 0.98 1.20 1.22 0.00 0.96 99
E 1 2 1 0.67 0.09 0.00 0.09 0.90 0.95 1.06 0.92 0.02 0.41 120
M 5 6 5 0.91 0.84 0.89 1.74 0.89 0.89 -0.53 -0.53 0.01 0.09 234
 
Base Pair (122:129)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 11 11 8 0.73 0.95 0.99 1.94 0.99 1.00 -0.24 -0.23 0.00 0.51 754
3 5 3 3 0.75 0.96 0.99 1.94 0.99 1.00 0.65 0.67 0.00 0.64 421
B 1 1 1 1.00 0.83 1.00 1.83 1.00 1.00 1.82 1.80 0.00 0.81 265
A 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.59 1.59 0.00 0.88 36
C 3 3 3 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.44 1.44 0.00 0.96 99
E 4 2 2 0.67 0.73 0.96 1.70 0.96 0.99 0.66 0.75 0.00 0.40 120
M 3 5 2 0.50 0.78 0.93 1.71 0.93 0.97 -0.46 -0.45 0.01 0.09 234
 
Base Pair (123:128)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 8 9 8 0.94 0.82 0.99 1.81 0.99 1.00 -0.06 -0.06 0.01 0.41 753
3 2 2 2 1.00 0.80 0.99 1.79 0.99 1.00 0.41 0.39 0.00 0.48 420
B 2 2 2 1.00 0.86 1.00 1.85 1.00 1.00 1.80 1.75 0.00 0.81 264
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.88 36
C 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.86 1.86 0.00 0.96 99
E 0 0 0 0.00 0.67 0.75 1.42 0.75 1.00 -0.24 -0.19 0.01 0.01 120
M 5 6 5 0.91 0.80 0.92 1.72 0.92 0.96 -0.47 -0.43 0.01 0.08 234
 

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