23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 1295


Base Pair (1295:1645)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 23 20 11 0.51 0.79 0.90 1.69 0.90 0.95 0.13 0.07 0.00 0.75 833
3 7 9 4 0.50 0.65 0.87 1.51 0.87 0.93 0.78 0.54 0.00 0.72 457
B 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.67 1.67 0.00 0.80 260
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.34 1.34 0.00 1.00 41
C 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.76 1.86 0.01 0.96 100
E 4 6 1 0.20 0.09 0.00 0.09 0.61 0.79 1.38 0.37 0.00 0.59 156
M 14 9 5 0.43 0.76 0.93 1.69 0.93 0.96 0.12 0.21 0.01 0.72 276
 
Base Pair (1296:1644)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 37 30 22 0.66 0.69 0.80 1.48 0.80 0.98 -0.21 -0.09 0.01 0.74 826
3 17 14 9 0.58 0.74 0.88 1.62 0.88 1.00 0.89 0.88 0.00 0.71 450
B 9 7 5 0.62 0.96 0.99 1.95 0.99 1.00 1.02 1.02 0.00 0.78 253
A 1 2 1 0.67 0.50 0.95 1.45 0.95 1.00 1.72 1.54 0.00 1.00 41
C 3 3 5 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.71 1.72 0.00 0.97 100
E 7 5 3 0.50 0.39 0.68 1.07 0.68 0.99 0.76 1.09 0.00 0.59 156
M 17 13 8 0.53 0.41 0.64 1.05 0.54 0.94 -0.39 -0.21 0.01 0.73 276
 
Base Pair (1297:1643)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 15 18 10 0.61 0.55 0.95 1.50 0.95 0.97 1.14 1.05 0.00 0.75 835
3 4 4 4 1.00 0.96 1.00 1.95 1.00 1.00 1.64 1.61 0.00 0.72 459
B 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.94 1.94 0.00 0.81 263
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 41
C 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.81 1.81 0.00 0.97 100
E 2 2 2 1.00 0.95 0.99 1.95 0.99 1.00 1.29 1.17 0.00 0.58 155
M 10 13 5 0.43 0.36 0.84 1.20 0.84 0.89 0.47 0.26 0.00 0.72 276
 
Base Pair (1298:1642)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 20 26 9 0.39 0.64 0.89 1.52 0.89 0.97 0.47 0.54 0.00 0.72 836
3 6 7 4 0.61 0.61 0.93 1.55 0.93 1.00 1.18 1.41 0.00 0.73 460
B 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.94 1.94 0.00 0.81 263
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 41
C 3 3 3 1.00 0.75 0.99 1.74 0.99 0.99 1.81 1.76 0.00 0.97 100
E 5 6 3 0.55 0.60 0.81 1.41 0.81 0.99 0.82 0.85 0.00 0.59 156
M 11 16 2 0.15 0.46 0.73 1.19 0.73 0.91 -0.17 -0.37 0.00 0.61 276
 

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