23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 15

Base Pair (15:525)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 34 52 18 0.42 0.30 0.60 0.89 0.44 0.89 0.32 0.14 0.02 0.63 671
3 14 19 4 0.24 0.64 0.87 1.51 0.26 0.94 0.63 0.68 0.00 0.63 399
B 1 4 1 0.40 0.33 0.98 1.32 0.02 1.00 1.93 1.83 0.00 0.76 247
A 5 4 1 0.22 0.30 0.61 0.91 0.17 0.67 0.33 0.77 0.00 0.88 36
C 3 9 0 0.00 0.48 0.70 1.18 0.15 0.37 0.85 0.43 0.00 0.45 46
E 8 11 2 0.21 0.48 0.86 1.34 0.80 0.89 0.86 0.91 0.00 0.43 116
M 17 24 14 0.68 0.69 0.83 1.52 0.83 0.92 0.49 -0.03 0.05 0.69 226
 
Base Pair (16:524)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 33 53 22 0.51 0.80 0.86 1.66 0.86 0.98 -0.06 -0.17 0.01 0.63 672
3 19 36 12 0.44 0.82 0.88 1.70 0.88 0.99 0.10 0.05 0.00 0.63 398
B 11 16 9 0.67 0.89 0.94 1.82 0.94 1.00 0.28 0.27 0.00 0.76 246
A 2 5 1 0.29 0.32 0.64 0.95 0.64 1.00 1.24 0.43 0.00 0.88 36
C 2 3 1 0.40 0.07 0.00 0.07 0.30 0.98 1.11 1.78 0.00 0.45 46
E 6 15 2 0.19 0.53 0.83 1.36 0.83 0.96 0.71 0.63 0.00 0.44 116
M 12 14 9 0.69 0.81 0.95 1.76 0.95 0.98 0.46 0.22 0.05 0.70 228
 
Base Pair (17:523)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 17 27 10 0.46 0.83 0.94 1.77 0.94 0.98 -0.39 0.09 0.15 0.47 676
3 7 12 5 0.53 0.91 0.96 1.88 0.96 0.99 0.62 0.38 0.00 0.64 402
B 0 4 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 1.00 2.00 1.81 0.00 0.77 250
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.69 1.70 0.00 0.88 36
C 2 2 1 0.50 0.25 0.94 1.19 0.94 0.96 1.59 1.81 0.00 0.45 46
E 6 7 4 0.61 0.88 0.95 1.83 0.95 0.96 0.72 0.67 0.00 0.43 116
M 8 13 4 0.38 0.50 0.69 1.19 0.69 0.92 -0.61 0.35 0.49 0.15 228
 
Base Pair (18:522)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 25 45 16 0.46 0.86 0.94 1.80 0.94 0.98 -0.34 0.31 0.15 0.47 676
3 13 19 6 0.38 0.85 0.94 1.80 0.94 0.98 0.77 0.68 0.00 0.64 402
B 5 4 3 0.67 0.92 0.98 1.90 0.98 1.00 1.27 1.37 0.00 0.77 250
A 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.69 1.70 0.00 0.88 36
C 4 6 2 0.40 0.71 0.96 1.67 0.96 0.96 1.18 1.38 0.00 0.45 46
E 6 13 1 0.10 0.51 0.83 1.35 0.83 0.94 0.86 0.42 0.00 0.44 116
M 8 20 8 0.57 0.93 0.96 1.88 0.96 0.96 -0.69 0.21 0.50 0.14 228
 
Base Pair (19:521)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 34 55 18 0.40 0.70 0.79 1.48 0.79 0.96 -0.81 -0.02 0.14 0.47 677
3 25 31 12 0.43 0.67 0.76 1.44 0.76 0.96 0.01 0.19 0.00 0.64 403
B 11 11 3 0.27 0.52 0.68 1.20 0.68 0.98 0.29 0.68 0.00 0.77 251
A 5 3 2 0.50 0.79 0.89 1.68 0.89 0.92 0.61 0.87 0.00 0.88 36
C 4 9 0 0.00 0.41 0.78 1.19 0.83 0.98 0.76 0.62 0.00 0.45 46
E 9 17 7 0.54 0.83 0.91 1.75 0.91 0.94 0.31 0.47 0.00 0.44 116
M 5 15 6 0.60 0.86 0.93 1.79 0.93 0.95 -0.64 -0.20 0.48 0.14 228
 
Base Pair (20:520)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 38 48 27 0.63 0.90 0.93 1.83 0.93 0.98 -0.74 -0.66 0.01 0.47 677
3 28 29 17 0.60 0.90 0.94 1.84 0.94 0.98 0.11 0.18 0.00 0.64 403
B 13 14 9 0.67 0.93 0.96 1.89 0.96 0.98 0.33 0.40 0.00 0.77 251
A 6 6 4 0.67 0.58 0.78 1.36 0.78 1.00 0.27 0.41 0.00 0.88 36
C 1 8 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.85 0.96 1.74 1.08 0.00 0.45 46
E 9 9 4 0.44 0.84 0.94 1.78 0.94 0.96 0.42 0.51 0.00 0.44 116
M 9 11 10 1.00 0.94 0.98 1.92 0.98 1.00 -0.60 -0.61 0.05 0.14 228
 
Base Pair (21:519)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 37 43 25 0.62 0.49 0.74 1.24 0.78 0.98 -0.67 -0.36 0.02 0.47 677
3 26 32 16 0.55 0.53 0.75 1.27 0.77 0.98 0.17 0.46 0.00 0.64 403
B 13 14 7 0.52 0.73 0.89 1.62 0.76 0.98 0.59 0.53 0.00 0.77 251
A 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.50 1.51 0.00 0.88 36
C 2 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.91 0.98 1.50 1.84 0.00 0.45 46
E 11 16 7 0.52 0.57 0.72 1.29 0.72 0.97 0.53 0.88 0.00 0.44 116
M 9 10 9 0.95 0.63 0.76 1.39 0.76 0.93 -0.58 -0.67 0.05 0.13 228
 
Base Pair (22:518)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 28 34 11 0.35 0.67 0.86 1.53 0.86 0.99 -0.39 -0.12 0.01 0.47 676
3 17 20 8 0.43 0.68 0.87 1.55 0.87 0.99 0.81 1.00 0.00 0.64 402
B 12 13 4 0.32 0.65 0.80 1.45 0.80 0.99 0.73 0.75 0.00 0.76 250
A 3 3 3 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.76 0.77 0.00 0.88 36
C 5 6 0 0.00 0.81 0.93 1.75 0.93 1.00 0.52 0.87 0.01 0.44 46
E 2 4 1 0.33 0.40 0.97 1.37 0.97 0.98 1.74 1.72 0.00 0.44 116
M 6 8 3 0.43 0.61 0.73 1.34 0.63 0.95 -0.67 -0.72 0.05 0.13 228
 
Base Pair (23:517)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 17 19 11 0.61 0.86 0.97 1.82 0.97 0.99 -0.03 -0.01 0.02 0.47 677
3 10 11 5 0.48 0.81 0.96 1.77 0.96 0.99 1.29 1.10 0.00 0.64 403
B 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.96 1.97 0.00 0.77 251
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.69 1.70 0.00 0.88 36
C 1 1 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.65 1.81 0.00 0.45 46
E 8 9 3 0.35 0.73 0.87 1.60 0.87 0.96 0.87 0.86 0.00 0.44 116
M 6 7 6 0.92 0.96 0.98 1.93 0.98 0.98 -0.64 -0.68 0.06 0.13 228
 
Base Pair (24:516)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 15 29 10 0.46 0.89 0.97 1.85 0.97 0.99 -0.14 -0.13 0.02 0.47 676
3 9 16 6 0.48 0.86 0.96 1.82 0.96 0.99 1.06 0.89 0.00 0.64 402
B 3 5 3 0.75 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.88 1.87 0.00 0.77 250
A 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.75 1.00 2.00 1.20 0.00 0.88 36
C 3 8 2 0.36 0.78 0.96 1.73 0.96 1.00 1.01 1.20 0.00 0.45 46
E 6 10 3 0.38 0.88 0.96 1.84 0.96 0.96 0.57 0.62 0.00 0.44 116
M 3 5 2 0.50 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.45 -0.57 0.06 0.13 228
 
Base Pair (30:510)   (Tertiary) Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 37 23 12 0.40 0.61 0.88 1.48 0.89 0.91 0.21 -0.49 0.19 0.47 678
3 10 13 7 0.61 0.88 0.97 1.86 0.97 0.99 0.88 0.75 0.00 0.64 403
B 1 3 0 0.00 0.50 0.99 1.49 0.98 0.99 1.91 1.81 0.00 0.77 250
A 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.85 0.87 0.00 0.88 36
C 1 2 0 0.00 0.33 0.87 1.20 0.13 0.13 1.31 1.56 0.00 0.45 46
E 7 8 5 0.67 0.92 0.96 1.88 0.96 1.00 0.15 0.41 0.01 0.44 117
M 26 8 5 0.29 0.90 0.95 1.85 0.95 0.98 0.02 -0.60 0.64 0.14 229
 
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