23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 150

Base Pair (150:176)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 25 30 23 0.84 0.97 0.98 1.95 0.98 0.99 -0.37 -0.34 0.00 0.50 759
3 21 24 19 0.84 0.96 0.98 1.95 0.98 0.99 0.67 0.64 0.00 0.65 426
B 13 14 11 0.81 0.92 0.98 1.90 0.98 0.99 1.11 1.15 0.00 0.82 270
A 3 3 3 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.95 0.95 0.00 0.88 36
C 4 5 4 0.89 0.89 0.99 1.88 0.99 0.99 1.49 1.43 0.00 0.96 99
E 5 7 5 0.83 0.98 0.99 1.97 0.99 0.99 0.40 0.32 0.00 0.41 120
M 0 1 0 0.00 0.83 0.92 1.76 0.92 0.92 -0.29 -0.30 0.00 0.04 234
 
Base Pair (151:175)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 34 35 29 0.84 0.88 0.93 1.81 0.93 0.98 -0.69 -0.76 0.00 0.50 759
3 29 31 25 0.83 0.84 0.91 1.75 0.91 0.98 0.09 -0.03 0.00 0.65 426
B 21 19 18 0.90 0.94 0.98 1.92 0.98 1.00 0.76 0.82 0.00 0.82 270
A 4 4 4 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.96 0.96 0.00 0.88 36
C 4 3 3 0.86 0.83 0.99 1.82 0.99 0.99 1.59 1.68 0.00 0.96 99
E 4 8 3 0.50 0.42 0.72 1.14 0.72 0.95 0.18 0.09 0.00 0.41 120
M 1 1 1 1.00 0.86 0.93 1.79 0.93 0.93 -0.30 -0.29 0.00 0.04 234
 
Base Pair (152:174)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 54 55 33 0.61 0.70 0.82 1.52 0.82 0.91 -0.82 -0.72 0.00 0.50 759
3 37 40 26 0.68 0.68 0.82 1.50 0.82 0.93 -0.06 0.14 0.00 0.65 426
B 28 29 22 0.77 0.81 0.88 1.70 0.88 0.95 0.01 0.11 0.00 0.82 270
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.29 1.29 0.00 0.88 36
C 17 15 7 0.44 0.69 0.80 1.49 0.80 0.82 0.12 0.13 0.01 0.95 99
E 8 10 3 0.33 0.19 0.00 0.19 0.60 0.84 0.18 0.52 0.01 0.40 120
M 0 0 0 0.00 0.86 0.92 1.78 0.92 1.00 -0.28 -0.27 0.00 0.04 234
 
Base Pair (153:173)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 40 46 36 0.84 0.87 0.93 1.80 0.93 0.96 -0.77 -0.69 0.01 0.48 759
3 31 34 27 0.83 0.88 0.93 1.81 0.93 0.97 -0.20 -0.12 0.00 0.63 426
B 23 22 19 0.84 0.84 0.91 1.74 0.91 0.97 -0.14 -0.06 0.00 0.78 270
A 1 2 1 0.67 0.89 0.97 1.86 0.97 0.97 1.24 1.19 0.00 0.88 36
C 9 12 9 0.86 0.63 0.92 1.55 0.92 0.92 0.56 1.02 0.09 0.87 99
E 7 10 7 0.82 0.84 0.96 1.80 0.96 0.97 0.37 0.44 0.00 0.41 120
M 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.23 -0.23 0.00 0.04 234
 
Base Pair (154:172)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 44 44 36 0.82 0.89 0.93 1.82 0.93 0.97 -0.75 -0.72 0.00 0.47 759
3 32 32 26 0.81 0.87 0.93 1.80 0.93 0.98 -0.17 -0.12 0.00 0.62 426
B 23 21 18 0.82 0.85 0.91 1.76 0.91 0.98 -0.14 -0.17 0.00 0.76 270
A 3 3 3 1.00 0.86 0.97 1.83 0.97 0.97 0.74 0.79 0.00 0.81 36
C 12 12 10 0.83 0.86 0.95 1.81 0.95 0.96 0.86 0.78 0.00 0.96 99
E 6 8 5 0.71 0.89 0.97 1.86 0.97 0.98 0.26 0.46 0.00 0.41 120
M 0 0 0 0.00 0.50 0.89 1.39 0.89 0.89 -0.19 -0.20 0.00 0.03 234
 
Base Pair (155:171)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 49 51 38 0.76 0.89 0.93 1.82 0.93 0.98 -0.90 -0.90 0.00 0.46 759
3 38 39 28 0.73 0.89 0.93 1.82 0.93 0.98 -0.48 -0.44 0.00 0.59 426
B 30 30 23 0.77 0.92 0.95 1.87 0.95 1.00 -0.24 -0.25 0.00 0.76 270
A 1 2 1 0.67 0.46 0.60 1.05 0.60 0.87 -0.70 -0.97 0.00 0.37 36
C 11 11 10 0.91 0.88 0.97 1.84 0.97 0.99 0.83 0.90 0.01 0.95 99
E 7 7 4 0.57 0.66 0.91 1.56 0.91 0.95 0.26 0.42 0.01 0.41 120
M 0 1 0 0.00 0.20 0.00 0.20 0.44 0.89 -0.21 -0.19 0.00 0.03 234
 
Base Pair (156:170)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 47 53 34 0.68 0.82 0.87 1.69 0.87 0.95 -0.91 -0.92 0.00 0.45 759
3 36 40 24 0.63 0.81 0.86 1.67 0.86 0.96 -0.52 -0.53 0.00 0.58 426
B 26 26 18 0.69 0.81 0.86 1.67 0.86 0.99 -0.36 -0.36 0.00 0.76 270
A 1 2 0 0.00 0.60 0.75 1.35 0.25 0.25 -0.76 -0.72 0.07 0.20 36
C 11 13 10 0.83 0.93 0.97 1.89 0.97 0.98 0.41 0.28 0.01 0.94 99
E 9 12 6 0.57 0.78 0.91 1.69 0.91 0.94 -0.09 -0.05 0.00 0.41 120
M 0 0 0 0.00 0.50 0.78 1.28 0.22 0.22 -0.22 -0.21 0.00 0.03 234
 
Base Pair (157:169)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 37 36 25 0.69 0.67 0.83 1.50 0.83 0.93 -0.72 -0.67 0.00 0.44 759
3 23 25 17 0.71 0.74 0.89 1.63 0.89 0.98 -0.28 -0.10 0.01 0.56 426
B 17 15 12 0.75 0.73 0.91 1.64 0.91 1.00 0.21 0.43 0.00 0.76 270
A 1 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.50 -0.68 -0.44 0.00 0.15 36
C 13 10 7 0.61 0.53 0.69 1.22 0.69 0.77 0.52 0.12 0.02 0.93 99
E 5 9 5 0.71 0.73 0.85 1.58 0.85 0.97 -0.20 0.07 0.02 0.38 120
M 1 1 1 1.00 0.50 0.83 1.33 0.00 0.17 -0.16 -0.14 0.00 0.02 234
 
Base Pair (158:168)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 18 23 8 0.39 0.10 0.00 0.10 0.27 0.90 -0.27 -0.52 0.01 0.43 759
3 11 10 5 0.48 0.06 0.00 0.06 0.29 0.97 0.62 0.08 0.00 0.56 426
B 5 3 1 0.25 0.11 0.00 0.11 0.03 0.99 1.15 1.28 0.00 0.75 270
A 1 1 1 1.00 0.50 0.75 1.25 0.00 0.25 -0.59 -0.37 0.07 0.10 36
C 6 13 3 0.32 0.17 0.00 0.17 0.18 0.65 0.17 0.32 0.07 0.85 99
E 5 6 3 0.55 0.56 0.93 1.50 0.93 0.94 0.53 0.68 0.00 0.40 120
M 1 0 0 0.00 0.50 0.83 1.33 0.33 0.33 -0.15 -0.17 0.00 0.02 234
 
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