23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 1527

Base Pair (1527:1544)   (Tertiary) Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 29 16 12 0.53 0.53 0.69 1.21 0.44 0.58 -0.71 -0.76 0.00 0.49 861
3 15 10 6 0.48 0.59 0.75 1.34 0.45 0.60 0.12 -0.10 0.00 0.69 485
B 9 3 1 0.17 0.51 0.85 1.36 0.26 0.29 0.36 0.40 0.00 0.73 264
A 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.57 0.56 0.07 0.73 41
C 14 6 6 0.60 0.32 0.54 0.86 0.35 0.41 -0.63 -0.43 0.05 0.72 100
E 6 6 5 0.83 0.82 0.95 1.77 0.82 0.99 0.46 0.57 0.01 0.63 180
M 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 -0.03 -0.06 0.00 0.00 276
 
Base Pair (1528:1543)   (Tertiary) Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 18 21 12 0.61 0.31 0.58 0.89 0.52 0.55 -0.74 -0.81 0.00 0.45 859
3 13 17 12 0.80 0.34 0.61 0.95 0.56 0.58 -0.04 -0.14 0.01 0.68 483
B 5 5 3 0.60 0.78 0.94 1.72 0.20 0.23 0.40 0.35 0.00 0.71 264
A 2 3 3 1.00 0.80 0.97 1.77 0.97 1.00 0.17 0.03 0.00 0.71 39
C 5 4 0 0.00 0.35 0.55 0.90 0.23 0.32 -0.68 -0.83 0.10 0.43 100
E 6 9 6 0.80 0.94 0.98 1.92 0.98 0.99 0.05 0.14 0.01 0.63 180
M 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.03 -0.06 0.00 0.00 276
 
Base Pair (1529:1542)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 53 47 31 0.62 0.52 0.64 1.17 0.64 0.85 -0.98 -0.92 0.04 0.43 859
3 39 34 25 0.69 0.48 0.63 1.11 0.63 0.84 -0.75 -0.48 0.07 0.57 483
B 21 18 10 0.51 0.31 0.54 0.86 0.47 0.67 -0.66 -0.74 0.13 0.48 262
A 5 6 6 1.00 0.82 0.94 1.75 0.94 0.94 -0.40 -0.35 0.00 0.76 41
C 14 13 6 0.44 0.61 0.71 1.31 0.71 0.89 -0.46 -0.38 0.01 0.86 100
E 13 10 9 0.78 0.51 0.72 1.23 0.72 0.98 -0.09 0.41 0.00 0.65 180
M 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.03 -0.06 0.00 0.00 276
 
Base Pair (1530:1541)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 55 49 28 0.54 0.55 0.69 1.25 0.69 0.83 -0.91 -0.84 0.00 0.50 859
3 40 37 22 0.57 0.49 0.68 1.17 0.68 0.81 -0.28 -0.14 0.00 0.69 483
B 24 23 12 0.51 0.38 0.55 0.94 0.55 0.67 -0.26 -0.23 0.00 0.72 262
A 7 4 3 0.55 0.44 0.71 1.15 0.71 1.00 -0.56 -0.12 0.00 0.76 41
C 15 12 6 0.44 0.68 0.78 1.47 0.78 0.91 -0.28 -0.49 0.01 0.84 100
E 9 10 7 0.74 0.64 0.85 1.49 0.85 0.98 0.14 0.24 0.00 0.65 180
M 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 -0.05 -0.05 0.00 0.01 276
 
Base Pair (1531:1540)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 56 51 37 0.69 0.60 0.70 1.30 0.70 0.86 -0.88 -0.94 0.00 0.50 859
3 40 41 29 0.72 0.59 0.70 1.29 0.70 0.84 -0.25 -0.40 0.00 0.70 483
B 25 21 18 0.78 0.44 0.65 1.09 0.65 0.76 -0.22 -0.29 0.00 0.73 262
A 4 4 3 0.75 0.79 0.87 1.66 0.87 1.00 -0.43 -0.56 0.00 0.76 41
C 16 10 8 0.61 0.54 0.69 1.24 0.69 0.93 -0.34 -0.42 0.03 0.82 100
E 11 16 8 0.59 0.60 0.76 1.36 0.76 0.94 0.08 -0.20 0.00 0.65 180
M 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 1.00 -0.05 -0.06 0.00 0.01 276
 
Base Pair (1532:1539)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 54 49 35 0.68 0.71 0.81 1.52 0.81 0.95 -0.91 -0.88 0.00 0.52 860
3 38 33 24 0.68 0.65 0.79 1.45 0.79 0.95 -0.26 -0.17 0.00 0.71 484
B 24 23 20 0.85 0.71 0.78 1.49 0.78 0.97 -0.44 -0.28 0.01 0.73 263
A 4 3 2 0.57 0.44 0.78 1.22 0.78 0.88 0.62 0.83 0.00 1.00 41
C 16 16 11 0.69 0.89 0.93 1.82 0.93 0.97 -0.41 -0.38 0.01 0.86 100
E 10 7 2 0.23 0.53 0.81 1.34 0.81 0.94 0.30 0.38 0.00 0.65 180
M 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 0.00 0.00 -0.06 -0.06 0.00 0.01 276
 
Base Pair (1533:1538)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 43 35 23 0.59 0.57 0.74 1.31 0.74 0.84 -0.88 -0.85 0.04 0.48 861
3 28 22 16 0.64 0.55 0.73 1.28 0.73 0.82 -0.18 -0.40 0.07 0.65 485
B 18 14 12 0.75 0.46 0.78 1.24 0.82 0.94 -0.17 -0.34 0.13 0.61 264
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.13 0.51 0.10 0.90 41
C 15 13 7 0.50 0.67 0.79 1.46 0.79 0.95 -0.37 -0.32 0.01 0.86 100
E 9 7 3 0.38 0.41 0.56 0.97 0.56 0.64 0.14 0.02 0.00 0.65 180
M 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 0.00 0.00 -0.06 -0.06 0.00 0.01 276
 
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