23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 1611


Base Pair (1611:1620)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 3 4 4 1.00 0.67 1.00 1.66 1.00 1.00 1.49 1.50 0.00 0.76 843
3 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.97 1.97 0.00 0.74 467
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.81 264
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 41
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.97 100
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.93 1.93 0.00 0.61 162
M 3 4 4 1.00 0.67 0.99 1.65 0.99 0.99 0.81 0.81 0.00 0.74 276
 
Base Pair (1612:1619)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 11 13 11 0.92 0.84 0.99 1.83 0.99 1.00 1.29 1.29 0.00 0.77 844
3 3 2 2 0.80 0.70 0.99 1.69 0.99 1.00 1.80 1.84 0.00 0.74 467
B 3 2 2 0.80 0.88 1.00 1.87 1.00 1.00 1.79 1.78 0.00 0.81 264
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 1.00 1.83 2.00 0.00 1.00 41
C 3 3 2 0.67 0.89 0.99 1.88 0.99 1.00 1.56 1.60 0.00 0.97 100
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.88 1.88 0.00 0.61 162
M 5 8 7 1.00 0.88 0.99 1.86 0.99 0.99 0.69 0.64 0.00 0.75 277
 

Last generated : Mon Jul 2 2001 (16 : 9)