23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 1764

Base Pair (1764:1988)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 63 52 30 0.52 0.39 0.72 1.11 0.72 0.77 0.31 0.33 0.00 0.77 809
3 12 14 9 0.69 0.72 0.94 1.65 0.94 1.00 0.96 0.86 0.00 0.69 432
B 7 7 7 1.00 0.97 0.99 1.96 0.99 1.00 0.73 0.83 0.00 0.72 236
A 1 2 0 0.00 0.56 0.90 1.46 0.90 1.00 1.47 1.24 0.00 1.00 41
C 8 7 7 0.93 0.92 0.99 1.91 0.99 0.99 1.27 1.47 0.02 0.96 101
E 4 5 2 0.44 0.24 0.86 1.10 0.86 0.99 1.71 1.32 0.00 0.59 155
M 43 31 14 0.38 0.27 0.50 0.77 0.30 0.33 0.10 0.48 0.00 0.88 276
 
Base Pair (1765:1987)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 48 51 31 0.63 0.88 0.92 1.80 0.92 0.93 0.06 0.10 0.00 0.77 809
3 10 11 8 0.76 0.96 0.98 1.95 0.98 0.99 0.47 0.46 0.00 0.68 432
B 9 10 7 0.74 0.94 0.97 1.91 0.97 0.99 0.55 0.40 0.00 0.72 236
A 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.24 1.24 0.00 1.00 41
C 6 6 6 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.43 1.43 0.00 0.98 101
E 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.90 1.90 0.00 0.59 155
M 32 34 17 0.52 0.56 0.80 1.36 0.80 0.81 0.40 0.64 0.00 0.88 276
 
Base Pair (1766:1986)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 53 55 43 0.80 0.94 0.96 1.90 0.96 0.97 0.15 0.17 0.00 0.77 809
3 16 18 17 1.00 0.99 0.99 1.98 0.99 0.99 0.62 0.68 0.00 0.68 432
B 13 15 14 1.00 0.98 0.99 1.98 0.99 0.99 0.52 0.48 0.00 0.72 236
A 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.09 1.09 0.00 1.00 41
C 8 7 7 0.93 0.95 0.99 1.94 0.99 1.00 1.23 1.25 0.00 0.98 101
E 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.79 1.86 0.00 0.59 155
M 29 30 19 0.64 0.75 0.90 1.65 0.90 0.92 0.57 0.63 0.00 0.89 276
 
Base Pair (1767:1985)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 35 35 25 0.71 0.94 0.96 1.91 0.96 0.98 0.17 0.17 0.00 0.77 809
3 7 8 5 0.67 0.97 0.98 1.95 0.98 0.99 0.32 0.41 0.00 0.68 432
B 5 7 4 0.67 0.93 0.97 1.90 0.97 0.99 0.80 0.91 0.00 0.72 236
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.83 1.83 0.00 1.00 41
C 4 4 4 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.72 1.62 0.01 0.97 101
E 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 1.00 1.94 2.00 0.00 0.59 155
M 24 23 16 0.68 0.87 0.92 1.79 0.92 0.96 0.47 0.43 0.00 0.89 276
 
Base Pair (1768:1984)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 48 41 22 0.49 0.64 0.81 1.45 0.81 0.92 0.17 0.63 0.00 0.77 808
3 14 10 4 0.33 0.51 0.83 1.34 0.83 0.90 0.44 1.11 0.00 0.68 431
B 7 5 2 0.33 0.52 0.76 1.27 0.76 0.83 0.24 1.03 0.00 0.72 236
A 5 4 1 0.22 0.33 0.55 0.88 0.60 0.97 0.28 0.60 0.00 0.98 40
C 5 4 4 0.89 0.50 0.89 1.39 0.89 1.00 0.98 1.46 0.00 0.98 101
E 2 1 1 0.67 0.75 0.99 1.74 0.99 0.99 1.83 1.86 0.00 0.59 155
M 29 27 14 0.50 0.49 0.75 1.24 0.74 0.93 0.28 0.49 0.00 0.89 276
 
Base Pair (1769:1983)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 45 45 27 0.60 0.83 0.87 1.70 0.87 0.97 0.04 0.04 0.00 0.77 808
3 15 15 7 0.47 0.68 0.80 1.49 0.80 0.97 0.18 0.05 0.00 0.68 432
B 11 12 6 0.52 0.90 0.94 1.84 0.65 0.94 0.05 0.24 0.00 0.72 236
A 3 3 1 0.33 0.94 0.98 1.91 0.98 1.00 0.82 0.84 0.00 1.00 41
C 9 9 8 0.89 0.97 0.99 1.96 0.99 0.99 1.05 1.06 0.00 0.98 101
E 1 0 0 0.00 0.80 0.99 1.79 0.99 1.00 1.83 1.73 0.00 0.59 155
M 21 21 12 0.57 0.83 0.94 1.77 0.94 0.96 0.61 0.67 0.00 0.88 275
 
Base Pair (1770:1982)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 28 35 8 0.25 0.58 0.75 1.33 0.60 0.98 0.37 0.44 0.00 0.77 809
3 7 15 2 0.18 0.68 0.83 1.51 0.63 0.99 0.84 0.52 0.00 0.68 432
B 4 13 0 0.00 0.16 0.00 0.16 0.32 0.97 1.18 0.86 0.00 0.72 236
A 2 1 1 0.67 0.50 0.95 1.45 0.95 1.00 1.44 1.72 0.00 1.00 41
C 1 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.99 1.74 1.73 0.02 0.96 101
E 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.94 1.94 0.00 0.59 155
M 20 18 6 0.32 0.52 0.75 1.26 0.75 0.98 0.29 0.69 0.00 0.89 276
 
Base Pair (1771:1980)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 15 12 6 0.44 0.31 0.93 1.25 0.93 0.99 1.43 1.71 0.00 0.78 815
3 7 4 2 0.36 0.23 0.90 1.13 0.90 0.99 1.34 1.75 0.00 0.68 432
B 2 3 2 0.80 0.89 1.00 1.89 1.00 1.00 1.72 1.77 0.01 0.72 236
A 2 1 0 0.00 0.24 0.61 0.85 0.56 0.95 0.70 1.35 0.00 1.00 41
C 2 1 0 0.00 0.50 0.99 1.49 0.99 0.99 1.84 1.92 0.00 0.98 101
E 3 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.83 0.99 1.31 1.93 0.00 0.59 155
M 6 7 4 0.61 0.59 0.97 1.56 0.97 1.00 1.50 1.64 0.00 0.90 282
 
Base Pair (1772:1979)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 25 30 19 0.69 0.82 0.97 1.79 0.97 0.99 1.33 1.32 0.00 0.78 815
3 10 15 7 0.56 0.77 0.96 1.72 0.96 0.99 1.36 1.30 0.00 0.68 432
B 8 7 5 0.67 0.93 0.98 1.91 0.98 0.99 1.21 1.23 0.00 0.72 236
A 0 1 0 0.00 0.50 0.98 1.48 0.98 0.98 1.83 1.67 0.00 1.00 41
C 5 5 5 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.39 1.39 0.00 0.98 101
E 2 7 2 0.44 0.39 0.91 1.30 0.91 1.00 1.61 1.39 0.00 0.59 155
M 10 10 7 0.70 0.86 0.98 1.84 0.97 0.98 1.30 1.34 0.00 0.90 282
 
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