23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 1775


Base Pair (1775:1789)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 3 7 1 0.20 0.48 0.99 1.46 0.99 0.99 1.88 1.79 0.00 0.81 842
3 1 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.98 1.93 0.00 0.73 458
B 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.96 2.00 0.00 0.80 261
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 41
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.98 101
E 0 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 0.97 2.00 1.83 0.00 0.59 156
M 2 5 1 0.29 0.61 0.97 1.59 0.97 0.97 1.73 1.59 0.00 0.91 283
 
Base Pair (1776:1788)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.97 1.97 0.00 0.81 843
3 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.73 459
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.80 262
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 41
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.98 101
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.59 156
M 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.92 1.92 0.00 0.91 283
 
Base Pair (1777:1787)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 4 7 4 0.73 0.28 0.98 1.26 0.98 1.00 1.93 1.81 0.00 0.80 842
3 1 2 1 0.67 0.33 1.00 1.33 1.00 1.00 1.98 1.89 0.00 0.72 459
B 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.96 1.85 0.01 0.80 262
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 41
C 1 2 1 0.67 0.75 0.99 1.74 0.99 0.99 1.81 1.73 0.00 0.98 101
E 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 1.00 2.00 1.90 0.00 0.59 156
M 2 3 2 0.80 0.18 0.00 0.18 0.96 1.00 1.93 1.75 0.00 0.90 282
 

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