23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 1830


Base Pair (1830:1975)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 29 26 10 0.36 0.40 0.66 1.06 0.58 0.61 0.41 0.35 0.00 0.80 836
3 12 9 4 0.38 0.70 0.86 1.56 0.60 0.62 0.62 0.78 0.00 0.69 432
B 5 4 1 0.22 0.53 0.97 1.50 0.96 0.97 1.57 1.68 0.00 0.72 236
A 3 2 1 0.40 0.39 0.73 1.12 0.73 0.88 0.55 1.04 0.00 1.00 41
C 1 2 2 1.00 0.75 0.99 1.74 0.96 0.99 1.81 1.76 0.00 0.98 101
E 4 3 2 0.57 0.50 0.96 1.46 0.02 0.02 1.65 1.61 0.00 0.59 155
M 16 15 4 0.26 0.38 0.51 0.88 0.42 0.47 0.26 0.14 0.00 0.96 303
 
Base Pair (1831:1974)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 35 33 26 0.77 0.91 0.96 1.87 0.96 0.99 0.67 0.59 0.00 0.80 835
3 12 11 9 0.78 0.95 0.97 1.93 0.97 0.99 0.60 0.55 0.00 0.69 432
B 9 8 6 0.71 0.78 0.95 1.73 0.95 0.99 1.29 1.18 0.00 0.72 236
A 3 3 3 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.54 0.54 0.00 1.00 41
C 5 6 5 0.91 0.70 0.97 1.67 0.97 1.00 1.64 1.53 0.00 0.98 101
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.59 155
M 18 16 12 0.71 0.80 0.94 1.74 0.94 0.98 0.83 0.74 0.00 0.97 302
 
Base Pair (1832:1973)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 11 10 7 0.67 0.16 0.00 0.16 0.81 1.00 1.18 1.69 0.00 0.80 836
3 2 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.65 1.00 1.08 1.97 0.00 0.68 432
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.72 236
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 41
C 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.92 1.92 0.00 0.98 101
E 2 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 1.00 1.86 1.93 0.00 0.59 155
M 8 9 6 0.71 0.81 0.98 1.78 0.98 1.00 1.32 1.40 0.01 0.96 303
 
Base Pair (1833:1972)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 6 6 5 0.83 0.91 1.00 1.90 1.00 1.00 1.80 1.83 0.00 0.81 844
3 2 3 2 0.80 0.75 1.00 1.75 1.00 1.00 1.94 1.92 0.00 0.69 432
B 2 3 2 0.80 0.75 1.00 1.75 1.00 1.00 1.90 1.86 0.00 0.72 236
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 41
C 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.92 1.92 0.00 0.98 101
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.59 155
M 3 2 2 0.80 0.94 1.00 1.93 1.00 1.00 1.62 1.70 0.01 0.99 311
 

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