23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 1906


Base Pair (1906:1924)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 17 17 15 0.88 0.96 0.99 1.95 0.99 0.99 0.74 0.74 0.00 0.80 845
3 4 4 2 0.50 0.67 0.99 1.66 0.99 0.99 1.77 1.80 0.00 0.69 433
B 2 2 1 0.50 0.88 1.00 1.87 1.00 1.00 1.67 1.77 0.01 0.72 237
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 41
C 2 3 2 0.80 0.50 0.98 1.48 0.98 0.98 1.86 1.72 0.00 0.98 101
E 2 2 1 0.50 0.25 0.98 1.23 0.98 0.99 1.90 1.86 0.00 0.59 155
M 11 10 11 1.00 0.94 0.99 1.93 0.99 0.99 0.62 0.62 0.00 0.96 311
 
Base Pair (1907:1923)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 2 5 1 0.29 0.20 0.00 0.20 0.01 1.00 1.85 1.80 0.00 0.80 850
3 0 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 2.00 1.95 0.00 0.69 438
B 0 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 2.00 1.92 0.00 0.74 242
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 41
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.98 101
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.59 155
M 2 3 1 0.40 0.25 0.98 1.23 0.03 1.00 1.64 1.58 0.00 0.96 311
 
Base Pair (1908:1922)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 12 14 10 0.77 0.98 0.99 1.97 0.99 0.99 0.72 0.73 0.00 0.80 850
3 3 3 1 0.33 0.98 0.99 1.97 0.99 0.99 0.68 0.69 0.00 0.69 438
B 2 2 0 0.00 0.82 0.98 1.80 0.98 0.98 1.44 1.46 0.00 0.74 242
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 41
C 4 4 4 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.30 1.30 0.00 0.98 101
E 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.94 1.94 0.00 0.59 155
M 5 7 5 0.83 0.95 1.00 1.95 1.00 1.00 1.36 1.38 0.00 0.96 311
 
Base Pair (1909:1921)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 26 21 16 0.68 0.94 0.96 1.91 0.96 0.99 0.18 0.26 0.00 0.80 850
3 5 5 3 0.60 0.98 0.99 1.97 0.99 0.99 0.60 0.55 0.00 0.69 438
B 2 2 0 0.00 0.81 0.98 1.79 0.98 0.98 1.44 1.40 0.01 0.74 242
A 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.16 1.16 0.00 1.00 41
C 6 5 5 0.91 0.79 0.97 1.76 0.97 1.00 1.30 1.40 0.00 0.98 101
E 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.94 1.94 0.00 0.59 155
M 15 11 8 0.61 0.75 0.93 1.68 0.93 0.99 0.52 0.60 0.01 0.96 311
 
Base Pair (1910:1920)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 10 10 6 0.60 0.74 0.99 1.73 0.96 0.99 1.57 1.58 0.00 0.80 850
3 2 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.93 1.95 0.00 0.69 438
B 2 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.98 1.88 1.96 0.00 0.74 242
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 41
C 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.81 1.81 0.00 0.98 101
E 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 1.00 2.00 1.94 0.00 0.59 155
M 7 7 5 0.71 0.87 0.99 1.85 0.92 0.99 1.18 1.16 0.00 0.96 311
 
Base Pair (1911:1919)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 2 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.82 1.86 0.00 0.80 852
3 2 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.90 1.98 0.00 0.70 440
B 2 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.98 1.83 1.95 0.00 0.74 244
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 41
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.98 101
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 2.00 1.94 0.00 0.59 155
M 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.71 1.71 0.00 0.96 311
 

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