23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 2023


Base Pair (2023:2040)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 59 63 45 0.74 0.94 0.96 1.89 0.96 0.97 0.01 0.02 0.00 0.81 846
3 15 14 13 0.90 1.00 1.00 1.99 1.00 1.00 0.33 0.32 0.00 0.69 434
B 8 6 5 0.71 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.42 0.46 0.00 0.72 238
A 3 3 3 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.28 0.28 0.00 1.00 41
C 4 4 4 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.68 1.68 0.00 0.98 101
E 4 5 5 1.00 0.92 0.99 1.92 0.99 0.99 1.54 1.50 0.00 0.59 155
M 40 45 28 0.66 0.82 0.88 1.70 0.88 0.91 0.08 0.10 0.00 0.99 311
 
Base Pair (2024:2039)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 43 47 31 0.69 0.71 0.87 1.58 0.85 0.97 0.51 0.49 0.00 0.81 847
3 15 9 8 0.67 0.67 0.91 1.58 0.84 0.96 0.83 0.76 0.00 0.69 435
B 11 7 6 0.67 0.69 0.86 1.55 0.73 0.93 0.52 0.33 0.00 0.73 239
A 3 1 1 0.50 0.33 0.90 1.24 0.85 1.00 1.26 1.72 0.00 1.00 41
C 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.73 1.73 0.00 0.98 101
E 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.75 1.75 0.00 0.59 155
M 26 36 21 0.68 0.67 0.83 1.50 0.83 0.96 0.44 0.53 0.01 0.99 311
 
Base Pair (2025:2038)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 41 41 35 0.85 0.94 0.98 1.92 0.98 0.98 0.46 0.43 0.00 0.81 847
3 16 16 14 0.88 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.27 0.24 0.00 0.69 436
B 8 8 6 0.75 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.62 0.58 0.00 0.73 240
A 6 6 6 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.41 0.41 0.00 1.00 41
C 3 1 1 0.50 0.33 0.96 1.29 0.96 1.00 1.68 1.86 0.00 0.98 101
E 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.25 1.25 0.00 0.59 155
M 22 24 20 0.87 0.83 0.95 1.78 0.95 0.96 0.81 0.72 0.00 0.99 310
 
Base Pair (2026:2037)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 51 39 35 0.78 0.90 0.93 1.83 0.93 0.99 0.12 0.15 0.00 0.81 849
3 18 15 14 0.85 0.98 0.99 1.97 0.99 0.99 0.23 0.22 0.00 0.69 437
B 15 13 12 0.86 0.97 0.98 1.95 0.98 1.00 0.18 0.15 0.00 0.74 241
A 2 1 1 0.67 0.91 0.98 1.89 0.98 0.98 1.16 1.20 0.00 1.00 41
C 7 1 1 0.25 0.07 0.00 0.07 0.57 1.00 1.00 1.71 0.01 0.97 101
E 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.70 1.70 0.00 0.59 155
M 26 23 20 0.82 0.93 0.97 1.91 0.97 0.99 0.53 0.53 0.00 0.99 311
 
Base Pair (2027:2036)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 7 8 6 0.80 0.74 0.99 1.73 0.99 0.99 1.73 1.75 0.00 0.81 848
3 1 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.87 1.96 0.00 0.69 436
B 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 2.00 1.88 0.00 0.74 240
A 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.90 0.90 1.54 2.00 0.00 1.00 41
C 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.98 2.00 1.86 0.00 0.98 101
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.88 2.00 0.01 0.59 155
M 6 6 6 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.53 1.53 0.00 1.00 311
 

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