23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 2120


Base Pair (2120:2178)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 20 16 7 0.39 0.42 0.67 1.09 0.67 0.98 -0.21 -0.33 0.00 0.55 847
3 9 10 3 0.32 0.59 0.82 1.41 0.82 1.00 1.09 0.86 0.00 0.69 437
B 0 4 0 0.00 0.02 0.00 0.02 0.81 1.00 1.96 1.25 0.00 0.74 241
A 1 2 1 0.67 0.67 0.98 1.64 0.98 1.00 1.72 1.55 0.00 1.00 41
C 4 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.10 1.00 1.60 1.86 0.00 0.98 101
E 8 4 2 0.33 0.41 0.80 1.21 0.80 1.00 0.92 1.23 0.00 0.59 155
M 7 5 4 0.67 0.33 0.51 0.85 0.51 0.78 -0.53 -0.47 0.00 0.13 309
 
Base Pair (2121:2177)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 11 9 11 1.00 0.98 1.00 1.98 1.00 1.00 0.10 0.10 0.00 0.55 847
3 7 6 7 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.57 1.52 0.00 0.69 437
B 5 5 5 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.48 1.44 0.00 0.74 241
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.55 1.55 0.00 1.00 41
C 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.92 1.92 0.00 0.98 101
E 1 0 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.79 1.73 0.00 0.59 155
M 3 2 3 1.00 0.95 0.98 1.92 0.98 1.00 -0.48 -0.49 0.00 0.13 309
 
Base Pair (2122:2176)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 12 8 11 1.00 0.87 0.99 1.86 0.99 1.00 0.11 0.12 0.00 0.55 847
3 9 6 8 1.00 0.94 0.99 1.93 0.99 0.99 1.57 1.56 0.00 0.69 437
B 4 3 3 0.86 0.88 0.99 1.87 0.99 0.99 1.65 1.68 0.00 0.74 241
A 3 3 3 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.18 1.18 0.00 1.00 41
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.98 101
E 2 0 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.70 1.63 0.00 0.59 155
M 3 2 3 1.00 0.75 0.90 1.65 0.90 1.00 -0.49 -0.49 0.00 0.13 309
 
Base Pair (2123:2175)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 7 7 7 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.05 0.05 0.00 0.55 847
3 4 4 4 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.34 1.33 0.00 0.69 437
B 3 3 3 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.15 1.15 0.00 0.74 241
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.24 1.24 0.00 1.00 41
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.98 101
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.59 155
M 3 3 3 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.41 -0.42 0.00 0.13 309
 
Base Pair (2124:2174)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 3 2 2 0.80 0.29 0.99 1.28 0.99 0.99 0.40 0.41 0.00 0.55 847
3 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.69 437
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.74 241
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 41
C 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.92 2.00 0.00 0.98 101
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.59 155
M 2 2 2 1.00 0.33 0.90 1.24 0.90 0.93 -0.38 -0.40 0.00 0.13 309
 

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