23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 2246


Base Pair (2246:2258)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 33 39 23 0.64 0.72 0.94 1.66 0.94 0.96 1.01 0.85 0.00 0.81 849
3 3 8 2 0.36 0.67 0.96 1.64 0.96 0.98 1.49 1.33 0.00 0.69 438
B 3 5 2 0.50 0.85 0.97 1.82 0.97 0.99 1.30 1.12 0.01 0.74 242
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 41
C 12 12 10 0.83 0.91 0.94 1.85 0.94 0.97 0.09 0.10 0.00 0.99 102
E 0 3 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.93 0.97 1.88 1.52 0.00 0.58 155
M 18 19 11 0.59 0.61 0.90 1.51 0.90 0.92 1.03 0.77 0.00 0.99 309
 
Base Pair (2247:2257)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 24 29 20 0.76 0.95 0.97 1.92 0.97 0.99 0.60 0.56 0.00 0.81 848
3 6 10 4 0.50 0.88 0.95 1.83 0.95 0.99 0.99 0.93 0.00 0.69 437
B 1 1 1 1.00 0.67 1.00 1.66 1.00 1.00 1.90 1.88 0.00 0.74 242
A 1 2 1 0.67 0.88 0.97 1.85 0.97 1.00 1.34 1.28 0.00 0.98 40
C 6 6 6 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.85 0.85 0.00 0.99 102
E 4 7 2 0.36 0.65 0.88 1.54 0.88 0.97 1.13 0.83 0.00 0.59 155
M 12 13 10 0.80 0.96 0.99 1.95 0.99 1.00 0.95 0.93 0.00 0.99 309
 
Base Pair (2248:2256)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 18 17 16 0.91 0.98 0.99 1.98 0.99 1.00 0.87 0.85 0.00 0.81 849
3 2 1 1 0.67 0.67 0.99 1.66 0.99 1.00 1.86 1.87 0.00 0.69 438
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 1.95 0.00 0.74 242
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.54 1.54 0.00 1.00 41
C 6 6 6 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.80 0.80 0.00 0.99 102
E 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 1.00 1.84 1.93 0.00 0.59 155
M 10 10 9 0.90 0.94 0.99 1.94 0.99 0.99 1.19 1.21 0.00 0.99 309
 
Base Pair (2249:2255)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 2 10 1 0.17 0.11 0.00 0.11 0.04 0.99 1.91 1.68 0.00 0.81 845
3 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 1.94 1.97 0.00 0.69 434
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 2.00 1.95 0.00 0.73 238
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 41
C 0 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 1.00 2.00 1.86 0.00 0.99 102
E 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 1.86 2.00 0.00 0.59 155
M 1 8 1 0.22 0.12 0.00 0.12 0.11 0.98 1.88 1.40 0.00 0.99 309
 

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