23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 2646

Base Pair (2646:2674)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 51 53 32 0.61 0.56 0.76 1.32 0.76 0.82 0.45 0.26 0.00 0.69 732
3 14 19 10 0.61 0.64 0.81 1.45 0.67 0.74 0.47 0.37 0.00 0.66 417
B 7 8 6 0.80 0.92 0.99 1.91 0.99 1.00 1.31 1.30 0.00 0.72 237
A 2 4 2 0.67 0.20 0.00 0.20 0.68 1.00 1.39 0.79 0.00 1.00 41
C 8 6 5 0.71 0.71 0.90 1.61 0.90 0.98 0.89 1.08 0.00 0.56 58
E 5 7 2 0.33 0.16 0.00 0.16 0.14 0.22 1.31 1.16 0.00 0.53 139
M 29 28 17 0.60 0.80 0.88 1.68 0.88 0.93 0.42 0.33 0.00 0.81 257
 
Base Pair (2647:2673)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 52 51 30 0.58 0.13 0.00 0.13 0.57 0.95 0.82 0.63 0.00 0.70 737
3 17 15 10 0.62 0.14 0.00 0.14 0.39 0.99 0.95 0.98 0.00 0.66 417
B 3 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 1.00 1.81 1.96 0.00 0.73 237
A 6 5 3 0.55 0.55 0.76 1.30 0.54 1.00 0.67 0.44 0.00 1.00 41
C 4 5 0 0.00 0.32 0.57 0.89 0.57 0.88 0.71 0.95 0.00 0.56 58
E 8 9 7 0.82 0.93 0.96 1.90 0.96 0.97 0.49 0.55 0.00 0.53 139
M 31 31 20 0.65 0.57 0.86 1.43 0.86 0.90 0.73 0.74 0.01 0.83 262
 
Base Pair (2648:2672)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 55 48 30 0.58 0.66 0.76 1.42 0.66 0.92 0.17 0.10 0.00 0.70 734
3 18 23 13 0.63 0.60 0.78 1.39 0.53 0.99 0.64 0.32 0.00 0.66 416
B 6 8 2 0.29 0.12 0.00 0.12 0.20 1.00 1.59 1.19 0.00 0.72 236
A 4 6 2 0.40 0.82 0.90 1.72 0.90 0.93 0.34 0.17 0.00 1.00 41
C 5 5 5 1.00 0.93 0.98 1.92 0.98 0.98 0.89 0.97 0.00 0.56 58
E 8 9 9 1.00 0.97 0.99 1.96 0.99 0.99 0.92 0.97 0.00 0.53 139
M 32 20 12 0.46 0.39 0.78 1.17 0.78 0.80 0.53 0.85 0.01 0.82 260
 
Base Pair (2649:2671)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 53 57 44 0.80 0.93 0.96 1.88 0.96 0.97 0.31 0.32 0.00 0.70 737
3 17 19 18 1.00 0.99 0.99 1.99 0.99 1.00 0.24 0.25 0.00 0.66 417
B 13 13 13 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.78 0.78 0.00 0.73 237
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.24 1.24 0.00 1.00 41
C 3 3 3 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.31 1.31 0.00 0.56 58
E 3 5 4 1.00 0.96 0.98 1.94 0.98 0.99 0.67 0.67 0.00 0.52 139
M 33 35 23 0.68 0.81 0.89 1.70 0.89 0.93 0.34 0.35 0.00 0.84 262
 
Base Pair (2650:2670)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 51 47 40 0.82 0.92 0.95 1.87 0.95 0.96 0.25 0.23 0.00 0.70 737
3 19 16 14 0.80 0.96 0.98 1.93 0.98 0.98 0.11 0.14 0.00 0.66 417
B 8 8 7 0.88 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.05 1.05 0.00 0.73 237
A 4 4 4 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.64 0.64 0.00 1.00 41
C 6 7 6 0.92 0.89 0.97 1.85 0.97 0.97 0.97 0.86 0.00 0.56 58
E 7 4 3 0.55 0.81 0.93 1.74 0.93 0.95 0.67 1.01 0.00 0.53 139
M 26 24 20 0.80 0.71 0.91 1.62 0.91 0.94 0.89 0.80 0.00 0.84 262
 
Base Pair (2651:2669)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 34 35 21 0.61 0.81 0.96 1.77 0.96 0.98 0.91 0.99 0.00 0.70 737
3 8 9 4 0.47 0.84 0.98 1.81 0.98 0.99 1.21 1.32 0.00 0.66 417
B 5 4 3 0.67 0.88 0.99 1.87 0.99 1.00 1.63 1.66 0.00 0.73 237
A 1 2 0 0.00 0.77 0.90 1.67 0.90 1.00 0.89 0.97 0.00 1.00 41
C 6 5 2 0.36 0.78 0.93 1.71 0.93 0.95 0.64 0.74 0.00 0.56 58
E 2 3 1 0.40 0.85 0.97 1.82 0.97 0.99 1.03 1.20 0.00 0.53 139
M 20 21 15 0.73 0.81 0.94 1.74 0.94 0.96 0.64 0.69 0.00 0.84 262
 
Base Pair (2652:2668)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 50 46 21 0.44 0.29 0.56 0.85 0.56 0.74 0.58 0.30 0.00 0.70 736
3 24 17 6 0.29 0.26 0.52 0.78 0.49 0.74 0.67 0.48 0.00 0.66 416
B 12 4 2 0.25 0.01 0.00 0.01 0.59 0.97 1.04 1.72 0.00 0.73 237
A 5 5 3 0.60 0.60 0.70 1.30 0.53 0.75 0.48 0.47 0.00 0.98 40
C 6 4 2 0.40 0.69 0.81 1.50 0.81 1.00 0.23 0.43 0.00 0.56 58
E 7 8 1 0.13 0.10 0.00 0.10 0.31 0.36 0.62 0.72 0.00 0.53 139
M 20 25 13 0.58 0.33 0.61 0.94 0.61 0.67 0.83 0.49 0.01 0.83 262
 
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