23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 265


Base Pair (265:427)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 12 8 4 0.40 0.22 0.97 1.19 0.97 0.98 0.53 0.58 0.00 0.63 869
3 6 2 0 0.00 0.07 0.00 0.07 0.97 0.98 1.81 1.89 0.00 0.82 515
B 1 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 0.98 1.94 1.87 0.00 0.85 277
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.88 36
C 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 0.99 1.86 1.92 0.00 0.97 100
E 5 1 0 0.00 0.12 0.00 0.12 0.96 0.97 1.65 1.92 0.00 0.76 202
M 6 5 4 0.73 0.67 0.93 1.59 0.93 0.97 -0.46 -0.45 0.01 0.13 254
 
Base Pair (266:426)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 9 9 9 1.00 0.97 1.00 1.97 1.00 1.00 0.45 0.48 0.00 0.63 868
3 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.70 1.70 0.00 0.82 514
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.85 276
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.82 1.82 0.00 0.88 36
C 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.92 1.92 0.00 0.97 100
E 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.45 1.45 0.00 0.77 202
M 6 6 6 1.00 0.88 0.97 1.85 0.97 0.97 -0.47 -0.45 0.01 0.13 254
 
Base Pair (267:425)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 32 28 25 0.83 0.92 0.98 1.91 0.98 0.99 -0.14 -0.10 0.00 0.63 868
3 16 15 13 0.84 0.97 0.99 1.96 0.99 1.00 0.92 0.96 0.00 0.82 514
B 7 7 6 0.86 0.99 1.00 1.99 1.00 1.00 0.74 0.74 0.00 0.85 276
A 2 3 2 0.80 0.93 0.97 1.90 0.97 1.00 0.67 0.56 0.00 0.88 36
C 7 5 5 0.83 0.55 0.95 1.50 0.95 0.96 1.36 1.56 0.00 0.97 100
E 7 5 5 0.83 0.86 0.99 1.85 0.99 1.00 1.61 1.67 0.00 0.77 202
M 9 8 7 0.82 0.88 0.93 1.80 0.93 0.93 -0.58 -0.59 0.00 0.13 254
 
Base Pair (268:424)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 25 27 20 0.77 0.84 0.96 1.80 0.96 0.98 -0.02 0.04 0.00 0.63 869
3 15 17 13 0.81 0.89 0.97 1.87 0.97 1.00 1.02 1.07 0.00 0.82 515
B 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.64 1.64 0.00 0.85 277
A 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.79 0.81 0.00 0.88 36
C 1 2 0 0.00 0.50 0.98 1.48 0.97 0.97 1.78 1.76 0.00 0.97 100
E 11 13 9 0.75 0.86 0.94 1.79 0.94 0.99 1.01 1.04 0.00 0.77 202
M 9 8 7 0.82 0.61 0.82 1.44 0.82 0.85 -0.56 -0.54 0.00 0.13 254
 

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