23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 2791


Base Pair (2791:2805)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 14 12 10 0.77 0.89 0.94 1.83 0.94 0.97 -0.78 -0.82 0.01 0.18 656
3 13 11 9 0.75 0.89 0.94 1.83 0.94 0.97 -0.86 -0.90 0.00 0.28 381
B 10 8 8 0.89 0.94 0.97 1.91 0.97 0.99 -0.71 -0.75 0.00 0.45 215
A 3 3 1 0.33 0.57 0.77 1.34 0.77 0.89 -0.46 -0.73 0.00 0.63 40
C 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.46 -0.52 0.06 0.15 56
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 126
M 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.03 -0.08 0.01 0.00 219
 
Base Pair (2792:2804)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 18 15 15 0.91 0.99 0.99 1.99 0.99 1.00 -0.88 -0.88 0.00 0.18 654
3 16 13 14 0.97 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.99 -0.99 0.00 0.28 379
B 12 9 10 0.95 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.84 -0.85 0.01 0.46 213
A 4 4 4 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.54 -0.54 0.00 0.63 40
C 2 2 1 0.50 0.88 0.94 1.81 0.94 1.00 -0.58 -0.57 0.00 0.15 56
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 126
M 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.08 0.01 0.00 219
 
Base Pair (2793:2803)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 22 21 22 1.00 0.97 0.98 1.96 0.98 0.99 -0.82 -0.83 0.00 0.19 652
3 20 19 20 1.00 0.97 0.98 1.95 0.98 0.99 -0.86 -0.86 0.00 0.29 377
B 17 16 18 1.00 0.98 0.99 1.97 0.99 0.99 -0.63 -0.62 0.00 0.49 211
A 3 3 2 0.67 0.89 0.96 1.85 0.96 0.96 -0.21 -0.24 0.00 0.63 40
C 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.70 -0.70 0.00 0.15 56
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 126
M 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.08 0.01 0.00 219
 
Base Pair (2794:2802)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 18 17 15 0.86 0.92 0.95 1.86 0.95 0.98 -0.81 -0.80 0.00 0.17 650
3 17 16 14 0.85 0.91 0.94 1.85 0.94 0.98 -0.91 -0.90 0.00 0.26 375
B 16 15 14 0.90 0.95 0.97 1.93 0.97 0.98 -0.76 -0.78 0.00 0.45 209
A 1 1 0 0.00 0.44 0.74 1.18 0.74 1.00 -0.80 -0.65 0.02 0.46 40
C 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.65 -0.65 0.00 0.13 56
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 126
M 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 219
 
Base Pair (2795:2801)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 8 9 9 1.00 0.91 0.96 1.86 0.96 0.97 -0.53 -0.52 0.00 0.09 693
3 8 9 9 1.00 0.90 0.96 1.86 0.96 0.97 -0.72 -0.70 0.00 0.14 384
B 6 7 7 1.00 0.88 0.94 1.83 0.94 0.96 -0.83 -0.80 0.00 0.22 218
A 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.79 -0.79 0.00 0.41 40
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 -0.11 -0.11 0.00 0.02 90
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 126
M 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 219
 
Base Pair (2796:2800)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 7 7 3 0.43 0.67 0.83 1.50 0.83 0.88 -0.39 -0.38 0.00 0.06 693
3 7 7 3 0.43 0.67 0.82 1.49 0.82 0.88 -0.56 -0.55 0.00 0.09 384
B 5 5 1 0.20 0.39 0.80 1.19 0.80 0.82 -0.52 -0.47 0.01 0.12 218
A 2 2 2 1.00 0.80 0.94 1.74 0.88 1.00 -0.69 -0.63 0.00 0.41 40
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 -0.11 -0.11 0.00 0.02 90
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 126
M 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 219
 

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