23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 2808

Base Pair (2808:2891)   (Tertiary) Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 21 18 3 0.15 0.34 0.69 1.03 0.67 0.86 -0.74 -0.05 0.23 0.30 421
3 17 9 2 0.15 0.39 0.70 1.10 0.65 0.88 -0.42 0.05 0.08 0.40 325
B 10 3 0 0.00 0.56 0.84 1.41 0.75 0.99 0.66 0.74 0.00 0.61 203
A 5 1 1 0.33 0.27 0.68 0.95 0.20 0.20 0.43 -0.11 0.32 0.61 38
C 4 1 1 0.40 0.75 0.94 1.69 0.90 0.94 0.85 0.33 0.04 0.48 52
E 2 5 1 0.29 0.32 0.52 0.83 0.30 0.63 -0.85 0.46 0.26 0.10 84
M 0 8 0 0.00 0.14 0.00 0.14 0.23 0.23 -0.32 -0.60 0.60 0.04 44
 
Base Pair (2811:2889)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 16 17 9 0.55 0.84 0.95 1.79 0.95 0.97 -0.31 0.61 0.16 0.39 420
3 9 7 3 0.38 0.85 0.96 1.81 0.96 0.97 0.80 0.84 0.00 0.51 326
B 2 1 1 0.67 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.89 1.87 0.00 0.62 203
A 0 1 0 0.00 0.25 0.92 1.17 0.92 1.00 1.83 1.51 0.00 0.93 38
C 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.77 1.76 0.00 0.48 50
E 7 5 2 0.33 0.66 0.88 1.53 0.88 0.90 0.88 0.69 0.00 0.32 85
M 5 8 4 0.61 0.67 0.81 1.47 0.81 0.84 -0.61 -0.50 0.55 0.10 44
 
Base Pair (2812:2888)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 32 33 23 0.71 0.90 0.95 1.84 0.95 0.96 -0.42 0.39 0.17 0.39 420
3 20 18 14 0.74 0.94 0.97 1.91 0.97 0.99 0.64 0.64 0.00 0.51 326
B 14 13 11 0.81 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.79 0.78 0.00 0.62 203
A 3 2 3 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.77 0.84 0.00 0.93 38
C 5 6 4 0.73 0.71 0.92 1.63 0.92 0.94 1.28 0.94 0.00 0.48 50
E 3 3 0 0.00 0.31 0.89 1.20 0.89 0.95 1.18 1.17 0.00 0.32 85
M 7 9 5 0.62 0.59 0.71 1.30 0.71 0.77 -0.61 -0.57 0.55 0.10 44
 
Base Pair (2813:2887)   (Tertiary) Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 33 36 23 0.67 0.84 0.90 1.74 0.90 0.91 -0.74 -0.06 0.16 0.38 420
3 23 26 17 0.69 0.85 0.90 1.75 0.90 0.90 0.06 0.11 0.01 0.51 326
B 13 13 7 0.54 0.85 0.90 1.75 0.90 0.90 -0.01 0.18 0.01 0.62 203
A 5 5 6 1.00 0.85 0.92 1.77 0.92 0.92 0.24 0.17 0.00 0.93 38
C 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.10 1.09 0.00 0.48 50
E 5 8 4 0.61 0.72 0.90 1.62 0.90 0.91 0.76 0.48 0.00 0.30 85
M 8 8 4 0.50 0.53 0.73 1.26 0.73 0.80 -0.58 -0.46 0.54 0.10 44
 
Base Pair (2814:2886)   (Tertiary) Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 34 27 17 0.56 0.40 0.79 1.18 0.79 0.87 -0.34 0.54 0.15 0.38 420
3 21 19 12 0.60 0.35 0.78 1.13 0.78 0.88 0.73 0.87 0.00 0.51 326
B 12 10 5 0.46 0.35 0.73 1.08 0.73 0.89 0.67 1.13 0.00 0.62 203
A 2 2 1 0.50 0.38 0.86 1.24 0.86 0.92 1.39 0.99 0.02 0.90 38
C 3 1 1 0.50 0.38 0.90 1.27 0.90 0.90 1.26 1.46 0.00 0.48 50
E 7 7 6 0.86 0.45 0.87 1.32 0.84 0.84 1.02 0.60 0.00 0.31 85
M 10 7 4 0.47 0.50 0.67 1.17 0.67 0.67 -0.62 -0.67 0.50 0.08 44
 
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