23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 301

Base Pair (301:316)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 52 63 39 0.68 0.78 0.89 1.66 0.89 0.93 -0.58 -0.65 0.00 0.62 887
3 40 50 30 0.67 0.79 0.89 1.68 0.89 0.94 0.30 0.23 0.01 0.84 533
B 26 26 22 0.85 0.92 0.95 1.86 0.95 0.97 0.26 0.20 0.00 0.85 277
A 3 2 3 1.00 0.92 0.97 1.90 0.97 1.00 0.94 0.78 0.00 0.88 36
C 9 10 7 0.74 0.78 0.94 1.72 0.94 0.98 0.76 0.68 0.00 0.95 100
E 11 22 5 0.30 0.38 0.81 1.19 0.81 0.88 0.79 0.68 0.01 0.82 220
M 3 3 2 0.67 0.44 0.61 1.05 0.61 0.65 -0.41 -0.43 0.00 0.07 254
 
Base Pair (302:315)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 49 41 34 0.76 0.85 0.92 1.76 0.92 0.96 -0.74 -0.84 0.15 0.45 887
3 40 33 26 0.71 0.86 0.91 1.77 0.91 0.97 0.00 -0.72 0.26 0.56 533
B 24 26 21 0.84 0.95 0.97 1.92 0.97 1.00 0.21 0.31 0.01 0.84 277
A 5 4 3 0.67 0.80 0.92 1.72 0.92 1.00 0.64 0.86 0.00 0.88 36
C 6 4 5 1.00 0.80 0.97 1.77 0.97 0.98 1.06 1.22 0.00 0.95 100
E 11 3 2 0.29 0.42 0.61 1.04 0.51 0.72 0.63 -0.72 0.62 0.15 220
M 3 4 3 0.86 0.57 0.74 1.31 0.74 0.78 -0.40 -0.41 0.00 0.07 254
 
Base Pair (303:314)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 56 57 47 0.83 0.83 0.88 1.71 0.88 0.93 -0.82 -0.80 0.01 0.61 886
3 49 50 38 0.77 0.81 0.87 1.68 0.87 0.92 -0.14 -0.09 0.01 0.81 532
B 24 30 21 0.78 0.86 0.91 1.77 0.91 0.94 0.17 0.27 0.01 0.84 277
A 6 6 6 1.00 0.87 0.92 1.79 0.92 0.94 0.44 0.15 0.00 0.88 36
C 5 5 7 1.00 0.71 0.96 1.67 0.96 0.99 1.08 1.26 0.00 0.95 100
E 19 14 11 0.67 0.67 0.80 1.47 0.80 0.89 -0.09 -0.02 0.02 0.76 219
M 2 2 2 1.00 0.75 0.83 1.58 0.83 0.92 -0.42 -0.44 0.00 0.08 254
 
Base Pair (304:313)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 58 55 29 0.51 0.62 0.73 1.35 0.73 0.88 -0.75 -0.73 0.00 0.62 885
3 51 47 23 0.47 0.38 0.58 0.97 0.67 0.85 0.20 0.23 0.00 0.84 531
B 29 23 9 0.35 0.32 0.52 0.84 0.47 0.77 0.39 0.30 0.00 0.85 278
A 6 6 4 0.67 0.78 0.89 1.67 0.89 0.94 0.40 0.48 0.00 0.88 36
C 4 6 4 0.80 0.82 0.98 1.80 0.98 0.99 1.26 1.18 0.00 0.95 100
E 16 18 10 0.59 0.80 0.89 1.69 0.89 0.94 0.28 0.26 0.00 0.82 217
M 3 2 2 0.80 0.85 0.91 1.75 0.91 1.00 -0.42 -0.40 0.00 0.07 254
 
Base Pair (305:312)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 46 37 20 0.48 0.43 0.74 1.17 0.74 0.82 -0.34 -0.42 0.00 0.62 887
3 39 27 16 0.48 0.55 0.84 1.39 0.84 0.92 0.64 0.89 0.00 0.84 533
B 19 8 3 0.22 0.20 0.78 0.98 0.78 0.90 0.95 1.58 0.00 0.85 277
A 3 3 3 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.02 1.02 0.00 0.88 36
C 5 8 2 0.31 0.33 0.78 1.11 0.14 0.22 0.94 0.59 0.00 0.95 100
E 17 16 10 0.61 0.78 0.90 1.68 0.90 0.94 0.37 0.34 0.00 0.83 220
M 2 2 2 1.00 0.50 0.86 1.36 0.86 1.00 -0.36 -0.36 0.00 0.07 254
 
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