23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 31


Base Pair (31:474)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 44 33 18 0.47 0.77 0.88 1.65 0.88 0.89 0.16 -0.00 0.02 0.63 678
3 6 9 4 0.53 0.96 0.98 1.94 0.98 0.99 0.46 0.16 0.02 0.63 401
B 2 3 2 0.80 0.75 1.00 1.75 1.00 1.00 1.91 1.88 0.00 0.76 249
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.88 36
C 1 4 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.31 1.43 0.00 0.45 46
E 4 6 2 0.40 0.89 0.95 1.85 0.95 0.99 0.42 0.34 0.06 0.42 116
M 37 20 14 0.49 0.54 0.67 1.20 0.67 0.67 -0.18 -0.10 0.02 0.70 231
 
Base Pair (32:473)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 16 16 9 0.56 0.53 0.96 1.50 0.96 0.97 1.47 1.29 0.02 0.64 681
3 3 3 2 0.67 0.79 0.99 1.78 0.99 0.99 1.72 1.61 0.02 0.64 403
B 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 1.97 0.00 0.77 251
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.88 36
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.45 46
E 3 2 2 0.80 0.85 0.98 1.83 0.98 0.99 1.28 1.25 0.04 0.43 116
M 13 13 7 0.54 0.43 0.91 1.34 0.91 0.93 1.07 0.63 0.02 0.70 232
 

Last generated : Mon Jul 2 2001 (16 : 9)