23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 325


Base Pair (325:337)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 42 44 31 0.72 0.83 0.93 1.76 0.93 0.96 -0.43 -0.49 0.00 0.63 891
3 28 27 19 0.69 0.75 0.93 1.68 0.93 0.97 0.94 0.71 0.01 0.85 537
B 18 18 13 0.72 0.85 0.95 1.79 0.95 0.99 0.85 0.75 0.00 0.86 281
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.82 1.82 0.00 0.88 36
C 11 12 9 0.78 0.83 0.95 1.78 0.95 0.96 0.65 0.48 0.00 0.94 100
E 9 8 5 0.59 0.61 0.91 1.52 0.90 0.93 1.03 0.75 0.01 0.82 220
M 3 5 3 0.75 0.67 0.87 1.54 0.87 0.87 -0.41 -0.46 0.00 0.10 254
 
Base Pair (326:336)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 15 13 14 1.00 0.94 0.99 1.94 0.99 1.00 0.33 0.32 0.00 0.64 891
3 11 10 10 0.95 0.98 1.00 1.98 1.00 1.00 1.52 1.52 0.00 0.85 537
B 5 5 5 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.66 1.66 0.00 0.86 281
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.88 36
C 3 3 3 1.00 0.71 0.98 1.69 0.98 1.00 1.50 1.41 0.00 0.95 100
E 6 5 5 0.91 0.96 0.99 1.96 0.99 0.99 1.33 1.34 0.00 0.84 220
M 1 0 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.36 -0.35 0.00 0.10 254
 
Base Pair (327:335)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 3 1 1 0.50 0.82 0.99 1.81 0.99 0.99 0.49 0.52 0.00 0.63 891
3 2 1 1 0.67 0.89 1.00 1.89 1.00 1.00 1.72 1.75 0.00 0.85 537
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.96 1.96 0.00 0.86 281
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.88 36
C 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.74 1.67 0.01 0.94 100
E 2 1 1 0.67 0.89 0.99 1.88 0.99 0.99 1.48 1.53 0.00 0.83 220
M 1 0 0 0.00 0.33 0.94 1.27 0.94 0.94 -0.36 -0.32 0.00 0.10 254
 

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