23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 413


Base Pair (413:2410)   (Tertiary) Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 17 51 9 0.27 0.89 0.96 1.86 0.96 0.98 -0.23 0.20 0.19 0.53 771
3 11 7 5 0.56 0.91 0.96 1.87 0.96 0.99 0.65 0.90 0.00 0.67 419
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.71 232
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.90 37
C 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.92 1.92 0.00 0.95 98
E 11 7 5 0.56 0.48 0.89 1.38 0.89 0.97 0.86 1.27 0.00 0.57 150
M 4 42 3 0.13 0.56 0.90 1.46 0.90 0.90 -0.45 -0.04 0.63 0.13 254
 
Base Pair (414:2409)   (Tertiary) Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 17 37 8 0.30 0.90 0.97 1.86 0.97 0.99 -0.36 -0.10 0.14 0.53 771
3 10 8 5 0.56 0.93 0.97 1.89 0.97 0.99 0.44 0.55 0.00 0.66 419
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 1.95 0.00 0.71 232
A 4 3 2 0.57 0.65 0.78 1.44 0.73 0.97 0.77 0.82 0.00 0.90 37
C 1 1 0 0.00 0.33 0.98 1.31 0.98 1.00 1.81 1.92 0.00 0.95 98
E 6 5 3 0.55 0.91 0.98 1.89 0.98 0.99 0.83 0.89 0.00 0.57 150
M 6 28 3 0.18 0.43 0.90 1.33 0.90 0.95 -0.46 -0.66 0.46 0.13 254
 
Base Pair (415:2408)   (Tertiary) Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 20 20 13 0.65 0.96 0.99 1.94 0.99 0.99 -0.39 -0.35 0.03 0.53 771
3 17 13 11 0.73 0.97 0.99 1.95 0.99 0.99 0.38 0.42 0.00 0.67 419
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.71 232
A 4 4 3 0.75 0.75 0.89 1.64 0.89 0.97 0.62 0.64 0.00 0.90 37
C 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.98 1.86 2.00 0.00 0.95 98
E 13 9 8 0.73 0.97 0.99 1.95 0.99 0.99 0.57 0.63 0.00 0.57 150
M 2 7 2 0.44 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.42 -0.75 0.11 0.13 254
 
Base Pair (416:2407)   (Tertiary) Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 24 23 17 0.72 0.90 0.94 1.84 0.94 0.99 -0.39 -0.51 0.02 0.53 772
3 18 16 11 0.65 0.84 0.93 1.76 0.93 0.99 0.52 0.54 0.00 0.67 420
B 7 6 5 0.77 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.00 1.01 0.00 0.71 233
A 3 4 2 0.57 0.67 0.78 1.45 0.78 0.95 0.40 0.39 0.00 0.90 37
C 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.81 1.81 0.00 0.95 98
E 8 6 4 0.57 0.60 0.85 1.45 0.85 0.98 0.65 0.64 0.00 0.57 150
M 5 6 5 0.91 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.55 -0.73 0.08 0.12 254
 

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