23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 57


Base Pair (57:70)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 9 6 7 0.93 0.91 0.99 1.90 0.99 1.00 0.21 0.25 0.00 0.51 726
3 2 1 1 0.67 0.97 1.00 1.97 1.00 1.00 1.56 1.53 0.00 0.64 406
B 2 1 1 0.67 0.97 1.00 1.97 1.00 1.00 1.44 1.46 0.00 0.77 252
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.88 36
C 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 1.00 1.84 2.00 0.00 0.84 87
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.91 1.78 0.01 0.44 118
M 6 5 6 1.00 0.89 0.95 1.84 0.95 0.95 -0.57 -0.58 0.00 0.12 233
 
Base Pair (58:69)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 4 7 3 0.55 0.55 0.98 1.53 0.98 0.99 0.47 0.46 0.00 0.52 733
3 2 3 1 0.40 0.20 0.00 0.20 0.99 1.00 1.93 1.84 0.00 0.64 406
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.77 252
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.88 36
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.91 94
E 2 3 1 0.40 0.20 0.00 0.20 0.97 0.99 1.81 1.56 0.01 0.45 118
M 2 4 2 0.67 0.67 0.87 1.54 0.87 0.90 -0.54 -0.51 0.00 0.12 233
 
Base Pair (59:68)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 25 21 15 0.65 0.46 0.68 1.14 0.68 1.00 -0.39 -0.22 0.00 0.52 735
3 14 9 5 0.43 0.14 0.00 0.14 0.59 1.00 0.68 1.06 0.00 0.65 408
B 8 6 3 0.43 0.26 0.62 0.88 0.52 1.00 0.66 0.95 0.00 0.78 254
A 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 1.00 1.29 2.00 0.00 0.88 36
C 5 6 4 0.73 0.98 0.99 1.97 0.99 1.00 1.00 1.00 0.00 0.91 94
E 5 3 2 0.50 0.44 0.87 1.32 0.87 1.00 1.22 1.31 0.01 0.45 118
M 6 6 6 1.00 0.76 0.85 1.61 0.85 0.95 -0.57 -0.60 0.00 0.12 233
 

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