23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 589

Base Pair (589:668)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 41 48 21 0.47 0.57 0.77 1.34 0.77 0.84 0.32 0.22 0.01 0.82 882
3 11 10 9 0.86 0.97 0.99 1.96 0.99 0.99 0.85 0.77 0.00 0.82 520
B 3 2 2 0.80 0.93 1.00 1.93 1.00 1.00 1.68 1.65 0.00 0.86 282
A 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.93 0.93 0.00 0.90 37
C 3 8 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.42 0.98 1.50 0.98 0.00 0.97 100
E 6 6 5 0.83 0.74 0.97 1.71 0.97 0.97 1.60 1.40 0.00 0.76 201
M 27 30 12 0.42 0.35 0.49 0.84 0.41 0.43 -0.01 -0.05 0.00 0.78 262
 
Base Pair (590:667)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 62 65 45 0.71 0.60 0.79 1.40 0.79 0.93 0.25 0.11 0.01 0.83 882
3 19 21 16 0.80 0.55 0.78 1.33 0.79 1.00 0.51 0.32 0.00 0.82 520
B 12 12 11 0.92 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.26 1.22 0.00 0.86 282
A 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 0.90 37
C 6 6 6 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.34 1.34 0.00 0.97 100
E 5 7 3 0.50 0.30 0.68 0.98 0.45 0.99 1.14 0.60 0.00 0.76 201
M 37 38 23 0.61 0.59 0.72 1.31 0.72 0.75 0.02 -0.19 0.01 0.79 262
 
Base Pair (591:666)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 59 51 41 0.74 0.90 0.94 1.84 0.94 0.98 0.01 0.01 0.01 0.83 881
3 25 19 16 0.73 0.88 0.94 1.81 0.94 1.00 0.22 0.30 0.00 0.82 519
B 16 12 9 0.64 0.82 0.90 1.72 0.90 1.00 0.13 0.22 0.00 0.86 281
A 4 3 3 0.86 0.80 0.95 1.75 0.95 1.00 1.03 1.13 0.00 0.90 37
C 5 5 5 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.39 1.39 0.00 0.97 100
E 5 4 4 0.89 0.95 0.99 1.94 0.99 0.99 1.14 1.18 0.00 0.76 201
M 29 27 20 0.71 0.87 0.92 1.79 0.92 0.94 -0.00 -0.06 0.01 0.79 262
 
Base Pair (592:665)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 49 55 33 0.64 0.67 0.81 1.49 0.81 0.95 0.19 0.28 0.00 0.83 881
3 28 34 18 0.58 0.57 0.73 1.30 0.73 0.93 0.29 0.37 0.00 0.82 519
B 15 19 10 0.59 0.28 0.54 0.82 0.63 1.00 0.53 0.42 0.00 0.86 281
A 3 3 2 0.67 0.93 0.97 1.90 0.97 0.97 0.72 0.79 0.00 0.90 37
C 3 2 2 0.80 0.75 0.99 1.74 0.99 1.00 1.76 1.81 0.00 0.97 100
E 10 12 6 0.55 0.47 0.82 1.29 0.82 0.84 0.90 0.69 0.00 0.76 201
M 18 19 13 0.70 0.85 0.92 1.77 0.92 0.95 0.28 0.17 0.00 0.80 262
 
Base Pair (593:664)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 61 66 42 0.66 0.71 0.79 1.50 0.79 0.96 -0.14 -0.00 0.00 0.82 882
3 33 36 25 0.72 0.73 0.84 1.57 0.84 0.99 0.12 0.29 0.00 0.82 520
B 21 24 14 0.62 0.54 0.67 1.20 0.74 0.99 0.13 0.02 0.00 0.86 282
A 6 6 6 1.00 0.77 0.89 1.66 0.89 1.00 0.34 0.44 0.00 0.90 37
C 8 8 2 0.25 0.02 0.00 0.02 0.39 0.99 1.12 1.24 0.00 0.97 100
E 6 6 5 0.83 0.69 0.97 1.66 0.97 0.99 1.51 1.58 0.00 0.76 201
M 20 22 15 0.71 0.64 0.85 1.49 0.85 0.90 0.12 0.14 0.01 0.75 262
 
Base Pair (594:663)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 49 52 30 0.59 0.60 0.73 1.33 0.47 0.94 0.04 0.01 0.00 0.81 882
3 19 16 10 0.57 0.81 0.91 1.72 0.45 1.00 0.46 0.52 0.00 0.82 520
B 5 5 2 0.40 0.12 0.00 0.12 0.07 1.00 1.61 1.65 0.00 0.86 282
A 4 2 0 0.00 0.53 0.78 1.31 0.76 1.00 0.60 0.70 0.00 0.90 37
C 8 14 8 0.73 0.41 0.77 1.18 0.77 1.00 1.18 0.73 0.00 0.97 100
E 10 9 8 0.84 0.69 0.92 1.61 0.91 0.99 0.90 1.01 0.00 0.76 201
M 22 22 12 0.55 0.44 0.63 1.07 0.40 0.77 -0.16 -0.10 0.01 0.73 262
 
Base Pair (595:662)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 63 54 38 0.65 0.67 0.80 1.47 0.80 0.90 -0.16 -0.04 0.00 0.80 882
3 40 35 26 0.69 0.56 0.68 1.24 0.76 0.85 0.05 0.09 0.00 0.82 520
B 23 19 14 0.67 0.77 0.87 1.64 0.87 1.00 0.23 0.50 0.00 0.86 282
A 4 2 1 0.33 0.47 0.76 1.23 0.76 1.00 0.56 0.75 0.00 0.90 37
C 12 7 4 0.42 0.47 0.70 1.17 0.70 0.98 0.13 0.79 0.00 0.97 100
E 13 14 11 0.81 0.40 0.59 0.99 0.60 0.63 0.36 0.15 0.00 0.76 201
M 11 12 8 0.70 0.79 0.94 1.73 0.94 0.96 0.03 0.12 0.01 0.70 262
 
Base Pair (596:661)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 58 56 28 0.49 0.53 0.72 1.25 0.72 0.81 -0.04 -0.05 0.01 0.79 882
3 36 33 19 0.55 0.64 0.75 1.39 0.75 0.86 0.08 0.18 0.00 0.82 520
B 19 19 10 0.53 0.66 0.79 1.45 0.79 0.85 0.36 0.59 0.00 0.86 282
A 4 4 4 1.00 0.83 0.89 1.73 0.89 0.97 0.29 0.23 0.00 0.90 37
C 8 3 2 0.36 0.39 0.92 1.30 0.92 0.97 1.31 1.68 0.00 0.97 100
E 13 10 5 0.43 0.50 0.66 1.17 0.66 0.86 0.38 0.34 0.00 0.76 201
M 14 20 7 0.41 0.20 0.56 0.76 0.56 0.59 0.16 -0.34 0.02 0.65 262
 
Base Pair (597:660)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 57 69 37 0.59 0.79 0.85 1.65 0.85 0.94 -0.28 -0.30 0.00 0.79 881
3 36 41 25 0.65 0.83 0.88 1.72 0.88 0.98 0.07 0.06 0.00 0.82 519
B 17 18 12 0.69 0.89 0.94 1.82 0.94 0.99 0.42 0.47 0.00 0.86 281
A 2 2 2 1.00 0.80 0.95 1.75 0.95 0.97 0.79 0.79 0.00 0.90 37
C 7 10 6 0.71 0.31 0.82 1.13 0.82 0.98 1.38 0.97 0.00 0.97 100
E 17 21 11 0.58 0.67 0.80 1.46 0.80 0.97 0.35 0.39 0.00 0.76 201
M 14 18 6 0.38 0.42 0.79 1.21 0.79 0.81 0.00 -0.24 0.01 0.65 262
 
Base Pair (598:659)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 45 54 28 0.57 0.60 0.70 1.30 0.70 0.92 -0.26 -0.27 0.00 0.79 882
3 33 38 21 0.59 0.34 0.46 0.81 0.57 0.91 0.10 0.08 0.00 0.82 520
B 17 19 13 0.72 0.43 0.62 1.04 0.65 0.98 0.24 0.32 0.00 0.86 282
A 1 1 1 1.00 0.67 0.97 1.64 0.97 1.00 1.70 1.52 0.00 0.90 37
C 2 6 0 0.00 0.18 0.00 0.18 0.91 0.91 1.72 1.47 0.00 0.97 100
E 15 18 7 0.42 0.13 0.00 0.13 0.39 0.78 0.43 0.58 0.01 0.76 201
M 10 10 7 0.70 0.74 0.93 1.68 0.93 0.94 -0.05 -0.10 0.00 0.65 262
 
Base Pair (599:658)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 35 36 32 0.90 0.97 0.98 1.96 0.98 0.99 -0.23 -0.24 0.00 0.78 881
3 22 22 22 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.09 0.07 0.00 0.82 519
B 12 12 12 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.26 0.26 0.00 0.86 281
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.90 37
C 1 1 0 0.00 0.67 0.99 1.66 0.98 0.98 1.81 1.78 0.00 0.97 100
E 10 10 10 1.00 0.99 0.99 1.98 0.99 0.99 0.83 0.76 0.00 0.76 201
M 12 13 10 0.80 0.89 0.95 1.84 0.95 0.97 -0.21 -0.31 0.01 0.61 262
 
Base Pair (600:657)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 4 6 1 0.20 0.01 0.00 0.01 0.28 1.00 0.60 0.05 0.00 0.64 882
3 2 6 1 0.25 0.01 0.00 0.01 0.35 1.00 1.89 1.05 0.00 0.82 520
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.86 282
A 1 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.30 1.00 1.59 1.25 0.00 0.90 37
C 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 1.00 1.86 2.00 0.00 0.97 100
E 1 5 1 0.33 0.06 0.00 0.06 0.85 1.00 1.85 1.34 0.00 0.76 201
M 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.09 1.00 -0.42 -0.37 0.00 0.14 262
 
Base Pair (601:656)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 7 6 4 0.61 0.50 0.99 1.49 0.99 0.99 0.57 0.62 0.00 0.63 882
3 1 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 1.00 1.96 1.98 0.00 0.82 520
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.86 282
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.90 37
C 2 2 1 0.50 0.33 0.96 1.29 0.96 0.98 1.62 1.86 0.00 0.97 100
E 1 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.99 1.92 1.96 0.00 0.76 201
M 4 3 3 0.86 1.00 1.00 2.00 0.98 1.00 -0.43 -0.41 0.00 0.14 262
 
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