23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 628


Base Pair (628:635)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 16 16 13 0.81 0.91 0.97 1.88 0.97 0.99 -0.15 -0.16 0.00 0.63 883
3 9 9 7 0.78 0.94 0.98 1.92 0.98 0.99 0.87 0.83 0.01 0.82 521
B 1 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 0.98 1.86 1.93 0.00 0.86 282
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.90 37
C 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 1.00 2.00 1.92 0.00 0.97 100
E 8 7 7 0.93 0.95 0.98 1.94 0.98 1.00 0.71 0.65 0.01 0.75 202
M 7 6 6 0.92 0.68 0.82 1.50 0.82 0.95 -0.57 -0.59 0.00 0.12 262
 
Base Pair (629:634)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 32 27 19 0.64 0.50 0.74 1.23 0.74 0.98 -0.56 -0.19 0.00 0.62 883
3 22 16 12 0.63 0.48 0.71 1.19 0.69 0.98 0.27 0.90 0.01 0.81 521
B 12 8 7 0.70 0.86 0.96 1.82 0.96 1.00 0.86 1.14 0.01 0.85 282
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.82 1.82 0.00 0.90 37
C 3 3 1 0.33 0.39 0.92 1.30 0.92 0.99 1.39 1.61 0.00 0.97 100
E 9 7 4 0.50 0.58 0.86 1.44 0.26 0.95 0.70 0.82 0.00 0.75 202
M 7 8 6 0.80 0.76 0.84 1.60 0.84 0.92 -0.57 -0.59 0.00 0.12 262
 

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