23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 736

Base Pair (736:760)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 20 30 16 0.64 0.74 0.91 1.65 0.77 0.98 0.67 0.68 0.01 0.84 885
3 7 11 2 0.22 0.78 0.90 1.68 0.63 0.99 0.82 0.67 0.00 0.83 522
B 1 1 0 0.00 0.67 1.00 1.66 1.00 1.00 1.91 1.94 0.00 0.86 281
A 1 3 0 0.00 0.09 0.00 0.09 0.73 1.00 1.82 0.99 0.00 0.90 37
C 3 3 3 1.00 1.00 1.00 2.00 0.99 0.99 1.78 1.78 0.00 0.97 100
E 5 7 2 0.33 0.08 0.00 0.08 0.10 0.97 1.52 1.53 0.00 0.78 204
M 10 16 11 0.85 0.78 0.96 1.74 0.96 0.97 0.83 0.97 0.03 0.81 263
 
Base Pair (737:759)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 45 43 30 0.68 0.73 0.93 1.66 0.93 0.98 0.80 0.92 0.00 0.84 882
3 13 11 7 0.58 0.55 0.92 1.47 0.92 0.99 1.09 1.38 0.00 0.82 519
B 7 3 2 0.40 0.16 0.00 0.16 0.87 1.00 1.25 1.82 0.00 0.85 277
A 3 4 2 0.57 0.90 0.97 1.87 0.97 1.00 0.76 0.79 0.00 0.90 37
C 7 9 5 0.62 0.67 0.93 1.60 0.93 0.94 1.20 1.02 0.00 0.97 100
E 3 4 3 0.86 0.73 0.98 1.71 0.98 0.98 1.59 1.54 0.00 0.78 205
M 25 23 18 0.75 0.88 0.94 1.82 0.94 0.96 0.38 0.45 0.01 0.83 263
 
Base Pair (738:758)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 41 48 35 0.79 0.96 0.98 1.94 0.98 0.99 0.38 0.46 0.01 0.84 887
3 24 26 20 0.80 0.97 0.99 1.96 0.99 0.99 0.40 0.53 0.01 0.82 524
B 15 17 13 0.81 0.98 0.99 1.97 0.99 0.99 0.29 0.46 0.02 0.84 282
A 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.59 1.59 0.00 0.90 37
C 3 3 4 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.56 1.56 0.00 0.97 100
E 7 7 5 0.71 0.89 0.98 1.87 0.98 0.98 1.29 1.35 0.00 0.78 205
M 14 19 11 0.67 0.83 0.95 1.78 0.95 0.97 0.76 0.80 0.00 0.84 263
 
Base Pair (740:757)   (Tertiary) Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 49 36 23 0.54 0.49 0.68 1.17 0.38 0.57 0.12 0.73 0.00 0.84 887
3 16 16 10 0.62 0.72 0.88 1.60 0.29 0.36 0.56 0.81 0.01 0.82 524
B 11 14 9 0.72 0.76 0.89 1.65 0.53 0.58 0.64 0.59 0.00 0.86 282
A 3 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.69 0.23 2.00 0.12 0.78 37
C 2 5 2 0.57 0.38 0.95 1.32 0.92 0.92 1.76 1.49 0.00 0.97 100
E 2 2 1 0.50 0.67 0.99 1.66 0.00 0.01 1.82 1.83 0.00 0.78 205
M 31 15 11 0.48 0.29 0.66 0.95 0.35 0.87 0.28 1.08 0.00 0.84 263
 
Base Pair (741:756)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 54 55 44 0.81 0.91 0.93 1.84 0.93 0.96 0.04 0.01 0.00 0.85 886
3 33 33 25 0.76 0.88 0.92 1.80 0.92 0.96 0.15 0.06 0.00 0.83 524
B 21 20 15 0.73 0.91 0.94 1.86 0.94 0.95 0.19 0.19 0.00 0.86 282
A 4 5 2 0.44 0.53 0.76 1.28 0.32 0.81 0.76 0.42 0.00 0.90 37
C 5 5 5 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.15 1.15 0.00 0.97 100
E 8 8 8 1.00 0.98 0.99 1.98 0.99 0.99 0.12 0.06 0.00 0.78 205
M 16 17 14 0.85 0.84 0.94 1.79 0.94 0.94 0.50 0.43 0.00 0.84 262
 
Base Pair (742:755)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 46 45 31 0.68 0.46 0.60 1.06 0.71 0.98 0.20 -0.03 0.01 0.83 887
3 23 23 10 0.43 0.46 0.71 1.17 0.51 0.97 0.24 0.50 0.03 0.81 524
B 20 17 9 0.49 0.73 0.84 1.58 0.84 0.96 0.18 0.47 0.00 0.86 282
A 2 2 1 0.50 0.50 0.86 1.36 0.71 0.95 0.61 -0.43 0.39 0.51 37
C 5 5 5 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.47 1.47 0.00 0.97 100
E 1 4 0 0.00 0.14 0.00 0.14 0.02 0.99 1.96 1.74 0.00 0.78 205
M 18 17 16 0.91 0.94 0.98 1.92 0.98 1.00 0.81 0.78 0.00 0.84 263
 
Base Pair (743:754)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 46 46 37 0.80 0.94 0.97 1.91 0.97 0.97 0.21 0.27 0.00 0.85 887
3 25 26 18 0.71 0.92 0.96 1.88 0.96 0.97 0.36 0.42 0.00 0.83 524
B 20 19 15 0.77 0.91 0.96 1.87 0.96 0.97 0.50 0.55 0.00 0.86 282
A 2 3 0 0.00 0.67 0.84 1.50 0.78 0.86 0.76 0.31 0.00 0.90 37
C 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.84 1.84 0.00 0.97 100
E 3 4 3 0.86 0.67 0.99 1.66 0.99 0.99 1.75 1.79 0.00 0.78 205
M 19 18 17 0.92 0.94 0.97 1.91 0.97 0.97 0.44 0.43 0.00 0.84 263
 
Base Pair (744:753)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 24 23 21 0.89 0.97 0.99 1.96 0.99 0.99 0.43 0.45 0.00 0.85 887
3 18 17 15 0.86 0.96 0.98 1.94 0.98 0.99 0.23 0.28 0.00 0.83 524
B 15 15 14 0.93 0.99 1.00 1.99 1.00 1.00 0.53 0.53 0.00 0.86 282
A 2 1 0 0.00 0.56 0.78 1.34 0.78 0.95 0.53 1.03 0.00 0.90 37
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.97 100
E 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 0.99 0.99 1.92 1.92 0.00 0.78 205
M 6 6 6 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.60 1.60 0.00 0.84 263
 
Last generated : Mon Jul 2 2001 (16 : 9)