23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 76

Base Pair (76:110)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 25 14 8 0.41 0.25 0.80 1.05 0.80 0.92 -0.09 0.01 0.00 0.51 745
3 14 7 4 0.38 0.12 0.00 0.12 0.75 0.90 0.98 1.09 0.00 0.64 413
B 6 5 4 0.73 0.44 0.98 1.43 0.98 0.99 1.76 1.81 0.00 0.79 258
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.88 36
C 3 2 2 0.80 0.80 0.99 1.79 0.99 0.99 1.67 1.76 0.00 0.95 98
E 8 2 0 0.00 0.44 0.74 1.18 0.16 0.71 0.48 0.04 0.00 0.40 119
M 8 5 2 0.31 0.71 0.82 1.53 0.82 0.88 -0.61 -0.55 0.02 0.11 234
 
Base Pair (77:109)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 35 36 28 0.79 0.68 0.85 1.52 0.85 0.86 -0.65 -0.59 0.01 0.51 745
3 25 24 19 0.78 0.71 0.84 1.55 0.81 0.82 -0.09 0.24 0.02 0.63 413
B 17 17 16 0.94 0.99 1.00 1.99 1.00 1.00 0.70 0.73 0.00 0.79 258
A 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.24 1.24 0.00 0.88 36
C 2 5 2 0.57 0.50 0.97 1.47 0.96 0.98 1.77 1.58 0.00 0.95 98
E 6 5 1 0.18 0.15 0.00 0.15 0.32 0.34 0.21 1.07 0.03 0.42 119
M 8 7 7 0.93 0.91 0.94 1.85 0.94 1.00 -0.62 -0.57 0.02 0.11 234
 
Base Pair (78:108)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 43 51 24 0.51 0.32 0.52 0.83 0.66 0.96 -0.77 -0.70 0.08 0.44 745
3 34 34 18 0.53 0.35 0.54 0.89 0.63 0.95 -0.60 0.18 0.14 0.52 413
B 29 24 13 0.49 0.36 0.60 0.96 0.59 0.99 0.36 0.37 0.00 0.79 258
A 3 3 3 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.88 0.88 0.00 0.88 36
C 5 12 2 0.23 0.20 0.00 0.20 0.63 0.98 1.56 0.88 0.00 0.95 98
E 2 7 2 0.44 0.50 0.74 1.25 0.74 0.93 0.05 0.48 0.03 0.42 119
M 4 5 4 0.89 0.82 0.94 1.76 0.94 0.97 -0.50 -0.47 0.02 0.11 234
 
Base Pair (79:107)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 43 35 25 0.64 0.60 0.81 1.41 0.81 0.85 -0.66 -0.49 0.00 0.51 745
3 32 24 16 0.57 0.54 0.76 1.30 0.76 0.80 0.04 0.35 0.01 0.64 413
B 18 16 11 0.65 0.85 0.96 1.80 0.96 1.00 0.80 0.91 0.00 0.79 258
A 5 5 5 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.37 0.37 0.00 0.88 36
C 7 6 7 1.00 0.92 0.99 1.91 0.99 1.00 1.28 1.31 0.00 0.95 98
E 9 3 0 0.00 0.35 0.88 1.23 0.88 0.97 1.00 0.76 0.01 0.42 119
M 4 5 2 0.44 0.77 0.88 1.64 0.88 1.00 -0.59 -0.55 0.02 0.11 234
 
Base Pair (80:106)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 16 15 10 0.65 0.30 0.82 1.12 0.82 0.84 -0.15 0.12 0.00 0.51 745
3 5 7 2 0.33 0.14 0.00 0.14 0.78 0.78 0.88 1.35 0.00 0.64 413
B 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 1.96 0.00 0.79 258
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.59 1.59 0.00 0.88 36
C 2 1 1 0.67 0.75 0.99 1.74 0.99 1.00 1.71 1.70 0.00 0.95 98
E 4 5 1 0.22 0.71 0.92 1.63 0.92 0.95 0.53 0.49 0.01 0.42 119
M 9 7 7 0.88 0.84 0.91 1.75 0.91 1.00 -0.60 -0.56 0.02 0.11 234
 
Base Pair (81:105)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 23 13 10 0.56 0.73 0.96 1.70 0.96 0.98 -0.06 -0.27 0.10 0.40 744
3 12 7 4 0.42 0.74 0.98 1.72 0.98 0.99 1.04 0.19 0.17 0.47 412
B 6 7 4 0.61 0.80 0.98 1.78 0.98 0.99 1.41 1.46 0.00 0.79 257
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.88 36
C 5 4 4 0.89 0.71 0.96 1.67 0.96 0.96 1.28 1.40 0.00 0.95 98
E 6 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 0.50 1.00 0.16 -0.17 0.37 0.01 119
M 6 2 2 0.50 0.74 0.83 1.56 0.83 0.93 -0.56 -0.57 0.00 0.09 234
 
Base Pair (82:104)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 24 27 9 0.35 0.51 0.82 1.33 0.09 0.75 -0.57 -0.66 0.08 0.40 745
3 16 21 5 0.27 0.51 0.79 1.29 0.07 0.67 -0.04 -0.57 0.12 0.47 413
B 7 16 3 0.26 0.65 0.86 1.51 0.09 0.72 0.66 0.52 0.00 0.79 258
A 4 5 2 0.44 0.25 0.67 0.92 0.00 0.25 1.10 0.73 0.00 0.88 36
C 4 4 3 0.75 0.50 0.96 1.46 0.04 0.96 1.57 1.58 0.00 0.95 98
E 5 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 -0.09 -0.05 0.00 0.00 119
M 4 2 1 0.33 0.56 0.70 1.26 0.48 0.85 -0.56 -0.45 0.01 0.09 234
 
Base Pair (85:97)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 11 14 9 0.72 0.71 0.96 1.68 0.96 0.98 -0.21 -0.23 0.01 0.40 746
3 5 6 5 0.91 0.58 0.98 1.57 0.98 1.00 0.42 0.35 0.00 0.47 413
B 4 5 4 0.89 0.56 0.98 1.54 0.98 1.00 1.84 1.76 0.00 0.79 257
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.69 1.69 0.00 0.88 36
C 3 6 3 0.67 0.42 0.93 1.35 0.93 0.97 1.53 1.42 0.00 0.96 99
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.05 -0.05 0.00 0.00 120
M 3 2 1 0.40 0.67 0.89 1.56 0.89 0.89 -0.50 -0.43 0.02 0.09 234
 
Base Pair (86:96)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 40 33 29 0.80 0.79 0.93 1.72 0.93 0.99 -0.68 -0.58 0.01 0.40 746
3 24 24 22 0.92 0.89 0.96 1.85 0.96 1.00 -0.41 -0.33 0.00 0.47 413
B 22 22 20 0.91 0.84 0.96 1.80 0.96 1.00 0.75 0.88 0.00 0.79 257
A 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.02 1.02 0.00 0.88 36
C 11 5 3 0.38 0.33 0.82 1.15 0.82 0.99 1.02 1.46 0.00 0.96 99
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 -0.05 -0.05 0.00 0.00 120
M 5 4 4 0.89 0.88 0.93 1.81 0.93 0.96 -0.59 -0.52 0.02 0.09 234
 
Base Pair (87:95)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 28 31 23 0.78 0.85 0.95 1.81 0.95 0.96 -0.55 -0.60 0.01 0.40 746
3 18 22 16 0.80 0.88 0.96 1.84 0.96 0.97 -0.33 -0.37 0.00 0.47 413
B 16 19 14 0.80 0.86 0.96 1.83 0.96 0.97 0.89 0.89 0.00 0.79 257
A 2 3 2 0.80 0.83 0.97 1.81 0.92 0.92 1.28 1.18 0.00 0.88 36
C 3 5 3 0.75 0.56 0.96 1.51 0.96 0.97 1.64 1.42 0.00 0.96 99
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 -0.05 -0.05 0.00 0.00 120
M 7 4 4 0.73 0.80 0.88 1.68 0.88 0.92 -0.54 -0.48 0.02 0.08 234
 
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