23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 777


Base Pair (777:787)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 28 28 14 0.50 0.23 0.67 0.90 0.67 0.92 1.21 0.90 0.00 0.81 847
3 8 11 6 0.63 0.20 0.61 0.81 0.61 1.00 1.56 1.00 0.00 0.77 484
B 7 7 5 0.71 0.56 0.92 1.48 0.92 1.00 1.56 1.30 0.00 0.74 242
A 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.82 1.82 0.00 0.90 37
C 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 0.98 0.98 1.86 1.86 0.00 0.97 100
E 1 4 1 0.40 0.00 0.00 0.00 0.18 1.00 1.52 1.60 0.00 0.78 205
M 19 16 7 0.40 0.29 0.67 0.96 0.67 0.74 0.68 0.84 0.00 0.84 263
 
Base Pair (778:786)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 10 10 5 0.50 0.49 0.97 1.46 0.97 0.98 1.63 1.70 0.01 0.81 846
3 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.83 1.98 0.01 0.76 483
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.81 2.00 0.02 0.74 242
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 1.00 2.00 1.82 0.00 0.90 37
C 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.78 1.78 0.00 0.97 100
E 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.86 2.00 0.01 0.77 204
M 7 8 3 0.40 0.47 0.93 1.40 0.93 0.95 1.38 1.35 0.00 0.84 263
 
Base Pair (779:785)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 27 41 16 0.47 0.72 0.85 1.57 0.21 0.69 0.73 0.55 0.00 0.81 845
3 9 7 4 0.50 0.91 0.95 1.85 0.09 0.52 0.71 0.55 0.00 0.76 482
B 5 2 2 0.57 0.69 0.93 1.61 0.15 0.93 1.41 1.19 0.00 0.73 240
A 2 3 1 0.40 0.69 0.86 1.55 0.08 0.65 1.12 0.78 0.00 0.90 37
C 6 9 4 0.53 0.72 0.84 1.56 0.55 0.97 1.02 0.57 0.00 0.97 100
E 2 2 1 0.50 0.25 0.98 1.24 0.01 0.01 1.92 1.82 0.00 0.78 205
M 12 25 8 0.43 0.26 0.68 0.94 0.32 0.89 1.32 0.84 0.00 0.84 263
 

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