23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 812


Base Pair (812:1195)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 37 37 29 0.78 0.91 0.97 1.88 0.97 0.98 0.45 0.38 0.00 0.77 819
3 6 8 6 0.86 0.92 0.99 1.91 0.99 0.99 1.42 1.30 0.01 0.72 456
B 0 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.95 1.82 0.01 0.72 237
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.92 0.92 2.00 1.59 0.00 0.90 37
C 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.92 1.92 0.00 0.97 100
E 6 6 6 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.00 0.89 0.00 0.69 182
M 30 28 22 0.76 0.83 0.91 1.75 0.91 0.96 0.11 0.07 0.00 0.81 263
 
Base Pair (813:1194)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 23 22 17 0.76 0.95 0.98 1.93 0.98 0.99 0.71 0.66 0.01 0.77 821
3 4 3 3 0.86 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.75 0.79 0.00 0.72 458
B 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.95 1.89 0.00 0.72 238
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.90 37
C 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 1.00 2.00 1.92 0.00 0.97 100
E 4 2 3 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.29 1.41 0.00 0.70 183
M 18 18 14 0.78 0.85 0.94 1.79 0.94 0.96 0.55 0.32 0.03 0.79 263
 
Base Pair (814:1193)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 27 23 20 0.80 0.94 0.99 1.93 0.99 0.99 1.06 1.07 0.00 0.77 821
3 11 10 9 0.86 0.99 1.00 1.99 1.00 1.00 1.12 1.14 0.00 0.72 458
B 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.92 1.92 0.00 0.73 238
A 3 3 3 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.69 0.69 0.00 0.90 37
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.97 100
E 7 6 5 0.77 0.99 0.99 1.98 0.99 1.00 0.91 0.88 0.00 0.70 183
M 16 13 11 0.76 0.87 0.97 1.84 0.97 0.97 0.77 0.78 0.01 0.81 263
 
Base Pair (815:1192)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 35 35 31 0.89 0.97 0.98 1.95 0.98 0.99 0.36 0.41 0.00 0.77 821
3 15 15 12 0.80 0.97 0.99 1.96 0.99 0.99 0.33 0.42 0.00 0.72 458
B 7 8 7 0.93 0.98 0.99 1.97 0.99 1.00 0.81 0.81 0.00 0.73 238
A 4 4 4 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.59 0.59 0.00 0.90 37
C 3 3 3 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.67 1.67 0.00 0.97 100
E 4 3 1 0.29 0.93 0.98 1.91 0.98 0.98 0.69 0.79 0.00 0.70 183
M 17 17 16 0.94 0.94 0.97 1.92 0.97 0.98 0.44 0.46 0.00 0.81 263
 
Base Pair (816:1191)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 48 44 40 0.87 0.95 0.98 1.93 0.98 0.99 0.28 0.31 0.00 0.77 820
3 17 15 13 0.81 0.96 0.99 1.95 0.99 1.00 1.13 1.19 0.00 0.72 457
B 11 11 9 0.82 0.96 0.99 1.95 0.99 1.00 1.02 1.05 0.00 0.72 237
A 1 0 0 0.00 0.80 0.97 1.77 0.97 1.00 1.43 1.51 0.00 0.90 37
C 6 6 6 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.67 1.67 0.00 0.97 100
E 5 4 4 0.89 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.25 1.36 0.00 0.70 183
M 25 23 21 0.88 0.89 0.94 1.83 0.94 0.96 0.42 0.46 0.00 0.81 263
 
Base Pair (817:1190)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 27 26 16 0.60 0.88 0.97 1.84 0.97 0.98 0.74 0.71 0.00 0.79 831
3 2 1 1 0.67 0.67 1.00 1.67 1.00 1.00 1.91 1.92 0.00 0.74 468
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.95 1.96 0.00 0.72 237
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.90 37
C 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.86 1.86 0.00 0.97 100
E 2 1 1 0.67 0.67 0.99 1.66 0.99 1.00 1.86 1.86 0.00 0.74 194
M 23 23 13 0.56 0.83 0.90 1.73 0.90 0.92 -0.04 -0.12 0.00 0.81 263
 

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