23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 946

Base Pair (946:971)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 42 34 23 0.60 0.63 0.90 1.53 0.90 0.93 0.76 0.61 0.00 0.81 863
3 9 7 6 0.75 0.74 0.96 1.70 0.96 0.99 1.38 1.22 0.00 0.77 487
B 5 5 5 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.23 1.23 0.00 0.74 243
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.58 1.58 0.00 0.85 36
C 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.71 1.61 0.01 0.96 100
E 3 1 0 0.00 0.05 0.00 0.05 0.90 0.98 1.79 1.50 0.00 0.79 208
M 31 25 15 0.54 0.56 0.75 1.31 0.75 0.78 0.10 0.11 0.00 0.83 276
 
Base Pair (947:970)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 21 21 11 0.52 0.92 0.95 1.87 0.95 0.98 0.10 0.14 0.00 0.81 864
3 7 5 1 0.17 0.89 0.94 1.83 0.94 0.98 0.48 0.58 0.00 0.77 488
B 5 5 1 0.20 0.37 0.92 1.29 0.91 0.97 1.35 1.54 0.00 0.74 243
A 1 0 0 0.00 0.67 0.92 1.58 0.83 1.00 0.96 1.19 0.00 0.88 36
C 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.76 1.76 0.00 0.97 100
E 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.87 1.95 0.00 0.79 209
M 12 14 8 0.61 0.88 0.96 1.84 0.96 0.98 0.48 0.44 0.00 0.83 276
 
Base Pair (948:969)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 33 36 24 0.70 0.79 0.95 1.74 0.95 0.98 0.87 0.85 0.00 0.81 861
3 7 7 2 0.29 0.51 0.95 1.46 0.95 0.98 1.36 1.33 0.00 0.77 486
B 4 3 2 0.57 0.37 0.95 1.32 0.95 0.97 1.62 1.44 0.01 0.74 243
A 2 4 0 0.00 0.52 0.64 1.16 0.64 0.97 0.32 0.10 0.00 0.88 36
C 6 6 6 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.42 1.42 0.00 0.97 100
E 1 0 0 0.00 0.83 0.99 1.83 0.99 0.99 1.78 1.76 0.00 0.78 207
M 20 23 16 0.74 0.89 0.95 1.84 0.95 0.97 0.37 0.36 0.00 0.83 275
 
Base Pair (949:968)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 66 70 47 0.69 0.80 0.88 1.68 0.88 0.97 0.11 0.09 0.01 0.81 863
3 27 28 20 0.73 0.83 0.91 1.74 0.91 0.98 0.24 0.12 0.01 0.77 487
B 20 20 13 0.65 0.85 0.90 1.76 0.90 0.97 0.19 0.01 0.01 0.73 242
A 3 3 3 1.00 0.28 0.49 0.77 0.51 1.00 0.11 0.18 0.02 0.85 36
C 18 19 10 0.54 0.79 0.86 1.65 0.86 0.88 0.27 0.36 0.00 0.97 100
E 4 5 4 0.89 0.88 0.98 1.86 0.98 1.00 1.19 1.17 0.00 0.79 209
M 21 23 17 0.77 0.74 0.84 1.58 0.84 0.97 -0.02 0.24 0.00 0.83 276
 
Base Pair (950:967)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 53 38 17 0.37 0.29 0.51 0.80 0.44 0.77 -0.05 0.35 0.00 0.81 859
3 19 14 3 0.18 0.53 0.72 1.25 0.20 0.63 0.23 0.52 0.00 0.76 483
B 11 7 1 0.11 0.25 0.85 1.10 0.15 0.99 1.12 1.29 0.00 0.74 242
A 2 3 2 0.80 0.58 0.86 1.44 0.86 0.94 0.71 0.85 0.00 0.88 36
C 15 8 4 0.35 0.24 0.68 0.92 0.36 0.97 0.49 1.09 0.00 0.97 100
E 6 4 0 0.00 0.11 0.00 0.11 0.14 0.14 0.45 1.48 0.00 0.77 205
M 19 16 10 0.57 0.73 0.92 1.65 0.92 0.95 0.43 0.52 0.00 0.83 276
 
Base Pair (951:966)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 54 52 36 0.68 0.87 0.93 1.79 0.93 0.97 0.17 0.25 0.00 0.81 859
3 23 21 13 0.59 0.87 0.93 1.80 0.93 0.97 0.67 0.74 0.00 0.76 483
B 12 13 8 0.64 0.85 0.96 1.81 0.96 0.98 1.20 1.20 0.00 0.74 242
A 8 6 5 0.71 0.48 0.61 1.09 0.56 0.94 0.04 0.34 0.00 0.88 36
C 10 10 9 0.90 0.74 0.94 1.68 0.87 0.98 0.97 0.98 0.00 0.97 100
E 3 2 0 0.00 0.75 0.96 1.71 0.96 0.97 1.18 1.24 0.00 0.77 205
M 21 21 14 0.67 0.82 0.94 1.76 0.94 0.95 0.41 0.42 0.00 0.83 276
 
Base Pair (952:965)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 38 39 33 0.86 0.91 0.95 1.87 0.95 0.97 0.15 0.09 0.00 0.81 862
3 9 8 6 0.71 0.94 0.97 1.91 0.97 0.98 0.57 0.50 0.00 0.77 486
B 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.98 2.00 1.88 0.00 0.74 243
A 4 4 4 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.88 0.88 0.00 0.88 36
C 7 7 7 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.97 0.97 0.00 0.97 100
E 5 3 2 0.50 0.54 0.95 1.49 0.95 0.97 1.36 1.29 0.00 0.77 207
M 22 24 20 0.87 0.81 0.91 1.72 0.91 0.95 0.19 0.12 0.00 0.83 276
 
Base Pair (953:964)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 44 46 19 0.42 0.48 0.68 1.16 0.52 0.89 0.23 0.23 0.00 0.81 863
3 18 16 5 0.29 0.46 0.66 1.11 0.34 0.83 0.28 0.44 0.00 0.77 487
B 9 8 2 0.23 0.02 0.00 0.02 0.52 0.67 1.02 1.34 0.00 0.74 243
A 3 5 2 0.50 0.39 0.78 1.16 0.33 0.97 1.32 0.73 0.00 0.88 36
C 7 13 3 0.30 0.23 0.74 0.97 0.31 0.97 1.21 0.88 0.00 0.97 100
E 6 3 1 0.22 0.24 0.89 1.14 0.14 1.00 1.28 1.47 0.00 0.78 208
M 19 17 11 0.61 0.84 0.94 1.78 0.94 0.95 0.30 0.37 0.00 0.83 276
 
Base Pair (954:963)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 33 24 15 0.53 0.54 0.77 1.31 0.48 0.97 0.36 0.35 0.01 0.80 863
3 7 8 5 0.67 0.85 0.93 1.78 0.49 1.00 0.62 0.53 0.00 0.77 487
B 2 2 1 0.50 0.31 0.95 1.27 0.07 1.00 1.63 1.79 0.00 0.74 242
A 1 4 1 0.40 0.12 0.00 0.12 0.58 1.00 1.69 1.00 0.00 0.88 36
C 3 2 1 0.40 0.50 0.98 1.48 0.04 1.00 1.72 1.86 0.00 0.97 100
E 4 2 3 1.00 0.90 0.99 1.89 0.96 0.99 1.18 1.21 0.00 0.79 209
M 23 14 9 0.49 0.41 0.63 1.04 0.63 0.91 0.57 0.51 0.02 0.81 276
 
Base Pair (955:962)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 28 26 20 0.74 0.42 0.81 1.24 0.86 0.99 0.65 0.50 0.01 0.80 864
3 13 14 10 0.74 0.49 0.78 1.27 0.80 1.00 0.71 0.48 0.00 0.77 488
B 10 11 6 0.57 0.38 0.63 1.01 0.60 1.00 0.85 0.35 0.00 0.74 243
A 3 2 2 0.80 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.83 0.72 0.05 0.83 36
C 6 6 4 0.67 0.92 0.99 1.91 0.99 1.00 1.28 1.29 0.00 0.97 100
E 0 1 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.81 1.81 0.00 0.79 209
M 9 6 6 0.80 0.72 0.94 1.67 0.94 0.98 0.70 0.58 0.02 0.81 276
 
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