23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 976


Base Pair (976:987)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 32 23 18 0.66 0.92 0.96 1.88 0.96 0.96 0.10 0.12 0.00 0.79 861
3 9 9 9 1.00 0.99 1.00 1.99 1.00 1.00 0.50 0.50 0.00 0.77 485
B 2 1 1 0.67 0.67 1.00 1.66 1.00 1.00 1.89 1.93 0.00 0.74 240
A 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.51 1.51 0.00 0.88 36
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.97 100
E 5 6 6 1.00 0.98 0.99 1.98 0.99 0.99 0.85 0.81 0.00 0.79 209
M 23 14 9 0.49 0.67 0.87 1.54 0.87 0.87 -0.01 0.20 0.01 0.78 276
 
Base Pair (977:986)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 11 11 8 0.73 0.75 0.99 1.74 0.99 0.99 1.46 1.44 0.00 0.79 864
3 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.86 1.88 0.00 0.77 488
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.74 243
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.59 1.59 0.00 0.88 36
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.97 100
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.83 1.86 0.00 0.77 209
M 10 10 7 0.70 0.72 0.97 1.69 0.97 0.97 0.81 0.73 0.00 0.78 276
 
Base Pair (978:985)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 15 15 10 0.67 0.64 0.98 1.62 0.98 0.98 1.34 1.33 0.00 0.79 865
3 2 3 2 0.80 0.60 1.00 1.60 1.00 1.00 1.90 1.82 0.00 0.77 489
B 2 2 2 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.86 1.82 0.00 0.74 243
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.88 36
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.97 100
E 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.95 1.83 0.00 0.79 210
M 13 12 8 0.64 0.64 0.93 1.58 0.93 0.94 0.53 0.55 0.00 0.78 276
 

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