23S rRNA Model Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 991

Base Pair (991:1163)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 61 55 31 0.53 0.63 0.75 1.38 0.75 0.86 -0.03 -0.02 0.01 0.78 846
3 16 10 7 0.54 0.78 0.88 1.66 0.88 0.99 0.36 0.67 0.01 0.74 470
B 11 4 2 0.27 0.16 0.00 0.16 0.78 1.00 1.07 1.66 0.01 0.74 240
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.29 1.30 0.00 0.88 36
C 11 11 6 0.55 0.45 0.69 1.14 0.69 1.00 1.13 0.94 0.00 0.97 100
E 4 5 4 0.89 0.83 0.98 1.82 0.98 0.98 1.41 1.38 0.00 0.73 194
M 34 34 18 0.53 0.38 0.54 0.92 0.54 0.55 -0.09 -0.08 0.04 0.78 276
 
Base Pair (992:1162)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 48 46 35 0.74 0.84 0.94 1.78 0.94 0.95 0.37 0.28 0.01 0.78 845
3 22 23 17 0.76 0.88 0.98 1.86 0.98 0.99 0.96 0.95 0.00 0.74 469
B 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.73 1.37 0.01 0.73 239
A 6 6 5 0.83 0.93 0.97 1.90 0.97 1.00 0.61 0.66 0.00 0.88 36
C 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.76 1.86 0.01 0.96 100
E 15 16 11 0.71 0.85 0.95 1.80 0.95 0.98 0.50 0.63 0.00 0.73 194
M 25 22 17 0.72 0.75 0.84 1.59 0.84 0.84 -0.05 -0.30 0.04 0.78 276
 
Base Pair (993:1161)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 57 52 46 0.84 0.91 0.95 1.85 0.95 0.97 0.07 0.05 0.01 0.78 847
3 39 32 31 0.87 0.90 0.94 1.84 0.94 0.99 0.14 0.15 0.00 0.75 471
B 17 17 17 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.69 0.61 0.01 0.74 240
A 5 5 5 1.00 0.84 0.92 1.76 0.92 1.00 0.42 0.37 0.00 0.88 36
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.97 100
E 17 10 9 0.67 0.80 0.88 1.67 0.88 0.97 0.03 0.20 0.00 0.74 195
M 18 20 15 0.79 0.86 0.93 1.80 0.93 0.93 0.10 0.01 0.03 0.78 276
 
Base Pair (994:1160)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 69 63 43 0.65 0.86 0.91 1.77 0.91 0.96 -0.08 -0.11 0.01 0.78 847
3 35 37 27 0.75 0.90 0.94 1.84 0.94 1.00 0.06 0.03 0.01 0.74 471
B 19 19 16 0.84 0.88 0.97 1.85 0.97 1.00 0.83 0.74 0.01 0.74 240
A 0 2 0 0.00 0.50 0.83 1.33 0.83 0.94 1.12 0.83 0.00 0.88 36
C 9 6 4 0.53 0.56 0.93 1.49 0.93 1.00 1.37 1.56 0.00 0.97 100
E 16 16 11 0.69 0.86 0.93 1.79 0.93 1.00 0.26 0.17 0.00 0.73 195
M 25 20 12 0.53 0.59 0.85 1.44 0.85 0.87 0.03 0.01 0.02 0.79 276
 
Base Pair (996:1159)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 37 32 28 0.81 0.95 0.97 1.93 0.97 0.98 0.44 0.37 0.01 0.78 846
3 21 18 17 0.87 0.98 0.99 1.97 0.99 1.00 0.70 0.62 0.01 0.74 470
B 10 7 6 0.71 0.93 0.99 1.92 0.99 1.00 1.31 1.24 0.01 0.74 241
A 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.69 1.70 0.00 0.88 36
C 2 2 1 0.50 0.40 0.97 1.37 0.97 0.98 1.71 1.72 0.01 0.96 100
E 10 10 10 1.00 0.98 0.99 1.98 0.99 0.99 0.54 0.53 0.00 0.73 193
M 14 12 10 0.77 0.79 0.95 1.73 0.95 0.96 0.32 0.21 0.02 0.78 276
 
Base Pair (997:1158)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 32 28 26 0.87 0.92 0.98 1.90 0.98 0.99 0.80 0.79 0.01 0.78 848
3 12 8 8 0.80 0.92 0.99 1.91 0.99 1.00 1.29 1.31 0.01 0.75 472
B 9 7 6 0.75 0.91 0.99 1.90 0.99 1.00 1.29 1.21 0.01 0.74 241
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.88 36
C 3 3 3 1.00 0.88 0.99 1.86 0.99 0.99 1.49 1.49 0.00 0.97 100
E 3 1 2 1.00 0.94 0.99 1.93 0.99 1.00 1.29 1.39 0.00 0.73 195
M 17 17 15 0.88 0.92 0.96 1.89 0.96 0.96 0.24 0.12 0.02 0.78 276
 
Base Pair (998:1157)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 43 34 28 0.73 0.90 0.94 1.84 0.94 0.95 -0.08 -0.08 0.01 0.77 847
3 18 12 11 0.73 0.93 0.97 1.90 0.97 0.97 0.59 0.73 0.00 0.75 471
B 10 7 6 0.71 0.91 0.98 1.89 0.98 1.00 1.19 1.21 0.01 0.74 241
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.88 36
C 8 4 3 0.50 0.33 0.90 1.23 0.90 0.95 1.26 1.63 0.00 0.97 100
E 8 5 5 0.77 0.59 0.94 1.52 0.94 0.94 1.01 1.39 0.00 0.73 194
M 17 18 14 0.80 0.83 0.90 1.73 0.90 0.90 -0.23 -0.34 0.03 0.77 276
 
Base Pair (1002:1153)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 40 34 25 0.68 0.78 0.95 1.73 0.95 0.96 0.66 0.76 0.01 0.75 847
3 6 6 4 0.67 0.84 0.99 1.83 0.99 1.00 1.65 1.69 0.00 0.74 471
B 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.96 2.00 0.00 0.74 241
A 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.82 1.82 0.00 0.88 36
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.97 100
E 5 6 4 0.73 0.87 0.98 1.85 0.98 1.00 1.41 1.42 0.01 0.73 194
M 34 28 21 0.68 0.71 0.84 1.56 0.84 0.86 -0.32 -0.20 0.02 0.70 276
 
Base Pair (1003:1152)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 25 13 8 0.42 0.67 0.97 1.64 0.97 0.98 0.78 0.71 0.08 0.69 847
3 4 4 2 0.50 0.61 0.99 1.60 0.99 0.99 1.76 1.78 0.00 0.75 472
B 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.92 2.00 0.00 0.74 241
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.88 36
C 1 1 1 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.81 1.81 0.00 0.97 100
E 3 4 2 0.57 0.67 0.98 1.65 0.98 0.99 1.60 1.53 0.00 0.74 195
M 20 8 5 0.36 0.66 0.91 1.57 0.91 0.92 -0.39 -0.55 0.27 0.47 275
 
Base Pair (1004:1151)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 49 36 24 0.56 0.91 0.95 1.86 0.95 0.96 0.17 -0.15 0.08 0.68 847
3 25 23 19 0.79 0.96 0.99 1.95 0.99 1.00 0.86 0.96 0.00 0.74 471
B 13 11 8 0.67 0.94 0.99 1.93 0.99 1.00 1.18 1.21 0.00 0.74 241
A 3 3 3 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.86 0.87 0.00 0.88 36
C 1 2 1 0.67 0.75 0.99 1.74 0.99 0.99 1.81 1.73 0.00 0.97 100
E 9 9 8 0.89 0.96 0.98 1.95 0.98 0.99 0.66 0.80 0.00 0.73 194
M 23 11 4 0.23 0.72 0.85 1.57 0.82 0.83 -0.18 -0.75 0.28 0.45 276
 
Last generated : Mon Jul 2 2001 (16 : 9)