23S rRNA Model Base Pair List

Last updated on 18 July 2001.

HEI Base Pair AI C
11:2902  
2:2901  
3:2900  
4:2899  
5:2898  
6:2897  
7:2896  
8:2895  
1515:525  
16:524  
17:523  
18:522  
19:521  
20:520  
21:519  
22:518  
23:517  
24:516  
30:510B 
3131:474  
32:473  
3535:445  
36:444  
37:442  
38:441  
39:440  
40:439  
41:438  
42:437  
43:436  
44:434  
45:433  
4646:179  
47:178  
5353:117B 
54:116  
55:115  
56:114  
5757:70  
58:69  
59:68  
6161:93K 
62:92K 
64:90K 
65:89K 
66:88K 
6767:74K 
7676:110  
77:109  
78:108  
79:107  
80:106  
81:105  
82:104  
85:97  
86:96  
87:95  
121121:130  
122:129  
123:128  
131131:148  
132:147  
133:146  
134:145  
135:144  
136:143  
137:142  
150150:176  
151:175  
152:174  
153:173  
154:172  
155:171  
156:170  
157:169  
158:168  
183183:214  
184:212  
185:211  
186:210  
187:209  
188:208  
194:201  
195:200  
224224:231  
225:230  
234234:430B, R 
235235:262  
236:261  
237:260  
238:259  
239:258  
245:253  
246:252  
265265:427  
266:426  
267:425  
268:424  
271271:366  
272:365  
273:364  
274:363  
281:359  
282:358  
283:357  
284:356  
285:355  
286:354  
287:353  
288:352  
289:351  
290:350  
291:349  
292:348  
293:347  
295:343  
296:342  
297:341  
301301:316  
302:315  
303:314  
304:313  
305:312  
317317:334K 
318:333K 
319319:323B 
325325:337  
326:336  
327:335  
375375:399  
376:398  
377:397  
378:396  
379:395  
380:394  
381:393  
382:392  
383:391B 
406406:421  
407:420  
408:419  
409:418  
410:417  
413413:2410K 
414:2409K 
415:2408K 
416:2407K 
461461:468  
462:467  
484484:496  
485:495  
486:494  
487:493  
531531:2018B 
533533:560  
534:559  
535:558  
536:557  
537:556B 
538:555B 
539:554  
540:553  
541:552  
542:551  
543:550  
544:549  
563563:578B 
564:577  
565:576B 
566:575  
579579:1261  
580:1260  
581:1259  
582:1258  
583:1257  
584:1256  
589589:668  
590:667  
591:666  
592:665  
593:664  
594:663  
595:662  
596:661  
597:660  
598:659  
599:658  
600:657  
601:656  
604604:624  
605:623  
606:622  
607:621  
610:618  
611:617  
628628:635  
629:634  
637637:651B 
638:650  
639:649  
640:648  
641:647  
671671:809  
672:808  
674:806B 
678:799  
679:798  
680:797  
681:796  
682:795  
683:794  
687687:775  
688:774  
689:773  
690:772  
691:771  
692:770  
693:769  
694:768  
695:767  
696:766  
697:765  
698:763B 
700700:732  
701:731  
702:730  
703:729  
707:724  
708:723  
709:722  
710:721  
711:720  
712:719  
713:718B 
736736:760  
737:759  
738:758  
740:757R 
741:756  
742:755  
743:754  
744:753  
777777:787  
778:786  
779:785  
812812:1195  
813:1194  
814:1193  
815:1192  
816:1191  
817:1190  
822822:835  
823:834  
824:833  
825:832  
826:831  
837837:942  
838:940  
839:939  
840:938  
841:937  
842:936  
843:935  
844:934  
847:933B 
848:930  
849:929  
850:928  
851:926  
852:925  
853:924  
854:923  
855:922  
856:921  
857:920B 
862:915  
863:913  
864:912  
868:909  
869:908  
870:907  
872:905  
873:904  
874:903  
875:902  
879:898  
880:897  
881:895  
882:894  
883:893  
884:892  
885:891  
946946:971  
947:970  
948:969  
949:968  
950:967  
951:966  
952:965  
953:964  
954:963  
955:962  
976976:987  
977:986  
978:985  
991991:1163  
992:1162  
993:1161  
994:1160  
996:1159  
997:1158  
998:1157  
1002:1153  
1003:1152  
1004:1151  
10051005:1138K 
1006:1137K 
10111011:1150  
1013:1149  
1014:1148  
1015:1147  
1016:1146  
1017:1145  
1018:1144  
10301030:1124  
1031:1123  
1032:1122B 
1034:1121  
1035:1120  
1036:1119  
1037:1118  
1038:1117  
1039:1116B 
1040:1115B 
1041:1114  
1042:1113  
1043:1112  
1051:1108  
1052:1107  
1053:1106  
1054:1105  
1055:1104B, R 
10571057:1081  
1058:1080  
1059:1079  
1062:1076  
1063:1075  
1064:1074  
10821082:1086B 
10871087:1102B 
1091:1100  
1092:1099B, R 
11641164:1185  
1165:1184  
1166:1183  
1167:1182  
1168:1181  
1169:1180  
1170:1179  
1171:1178  
1172:1177  
11961196:1250B 
1198:1247  
1199:1246  
1200:1245  
1201:1244  
1202:1243  
1203:1242B 
1204:1241B 
1206:1240  
1207:1239  
1208:1238  
1215:1234  
1216:1233  
1217:1232  
1218:1231  
1219:1230  
1220:1229  
1221:1228  
1222:1227  
12621262:2017  
1263:2016B 
1269:2011  
1270:2010  
12761276:1294  
1277:1293  
1278:1292  
1279:1291  
1280:1290  
1281:1289  
12951295:1645  
1296:1644  
1297:1643  
1298:1642  
13031303:1625  
1304:1624  
1305:1623  
1306:1622  
13091309:1605  
1310:1604  
13141314:1338  
1315:1337  
1316:1336  
1317:1335  
1318:1334  
1319:1333  
1323:1331  
1324:1330  
13431343:1404K 
1344:1403K 
13451345:1601  
1346:1600  
1347:1599  
1348:1598B 
13501350:1381  
1351:1380  
1355:1376  
1356:1375  
1357:1374  
1359:1372B 
1361:1370  
1362:1369  
1363:1368  
13851385:1402  
1386:1401  
1387:1400  
1388:1399  
1389:1398  
14051405:1597  
1406:1596  
1407:1595  
1408:1594  
1409:1593  
1410:1592  
1411:1591  
1412:1590  
1413:1589  
1414:1588  
1415:1587  
1416:1582  
1417:1581  
1420:1578  
1421:1577  
1422:1576  
1423:1575  
1424:1574  
1425:1573B 
1429:1564  
1430:1563  
1431:1562  
1432:1561  
1435:1557  
1436:1556  
1437:1555  
1440:1551  
1441:1550  
1442:1549  
1443:1548  
1444:1547  
14451445:1466  
1446:1465  
1447:1464  
1448:1463  
1449:1462  
1450:1461  
14671467:1525  
1468:1524  
1471:1520  
1472:1519  
1473:1518  
1474:1517  
1478:1513  
1479:1512  
1480:1511  
1481:1510  
1482:1507  
1483:1506  
1484:1505  
1485:1504  
1486:1503  
1487:1502  
1488:1501  
1489:1500  
1491:1499  
1492:1498  
15271527:1544B 
1528:1543B 
1529:1542  
1530:1541  
1531:1540  
1532:1539  
1533:1538  
16111611:1620  
1612:1619  
16271627:1639  
1628:1638  
1629:1637  
1630:1636  
16481648:2009  
1649:2008  
1650:2007  
1651:2006  
1656:2004  
1657:2003  
1658:2002  
1659:2001  
1660:2000  
1661:1999  
1662:1998  
1663:1997  
1665:1995  
1666:1994  
1667:1993  
16821682:1706  
1683:1705  
1684:1704  
1685:1703  
1686:1702  
1690:1697B 
1691:1696  
17071707:1751  
1708:1750  
1709:1749  
1710:1748  
1711:1747  
1712:1746  
1716:1743  
1717:1742  
1718:1741  
1724:1736  
1725:1735  
1726:1734  
1727:1733  
17521752:1756B 
17641764:1988  
1765:1987  
1766:1986  
1767:1985  
1768:1984  
1769:1983  
1770:1982  
1771:1980  
1772:1979  
17751775:1789  
1776:1788  
1777:1787  
17821782:2586K 
17921792:1827  
1793:1826  
1794:1825  
1795:1824  
1796:1823  
1797:1822  
1798:1821  
1799:1820  
1800:1817B 
1803:1814B 
1804:1813  
1805:1812  
1806:1811  
18301830:1975  
1831:1974  
1832:1973  
1833:1972  
18351835:1905  
1836:1904  
1837:1903  
1840:1902  
1841:1901  
1842:1898  
1843:1897  
1844:1896  
1845:1895  
1846:1894  
1849:1893  
1850:1892  
1851:1891  
1855:1887B 
1856:1886B 
1858:1884B 
1859:1883B 
1860:1882  
1861:1881  
1862:1880  
1863:1879  
1864:1878  
1867:1874  
1868:1873  
19061906:1924  
1907:1923  
1908:1922  
1909:1921  
1910:1920  
1911:1919  
19251925:1929B 
19351935:1962B, R 
1945:1961  
1946:1960  
1947:1959  
1948:1958  
1949:1957  
1950:1956R 
20232023:2040  
2024:2039  
2025:2038  
2026:2037  
2027:2036  
20432043:2625  
2044:2624  
2045:2623  
2046:2622  
2047:2621  
2048:2620  
2049:2619  
2050:2618  
2052:2617  
2053:2616  
2054:2615  
2056:2612  
2057:2611R 
20642064:2446  
2065:2445  
2066:2444  
2067:2443  
2069:2442  
2070:2441  
2071:2438  
2072:2437  
2073:2436  
2074:2435  
2075:2434  
20772077:2243  
2078:2242  
2079:2241  
2080:2240  
2084:2235  
2085:2234  
2086:2233B 
2087:2232  
2088:2231  
2089:2230  
2090:2229  
20932093:2196  
2094:2195  
2095:2194  
2096:2193  
2097:2192  
2098:2191  
2099:2190  
2100:2189  
2101:2188  
2102:2187  
2103:2186  
2104:2185B 
2105:2184  
2106:2183  
2107:2182  
2108:2181  
2109:2180B 
2110:2179  
21122112:2169K 
21132113:2170K 
21172117:2172K 
21202120:2178  
2121:2177  
2122:2176  
2123:2175  
2124:2174  
21272127:2161  
2128:2160  
2129:2159  
2136:2155  
2137:2154  
2138:2153  
2139:2152  
2140:2151  
2141:2150  
2142:2149  
2143:2148  
2144:2147B, R 
22002200:2223  
2201:2222  
2202:2221  
2204:2220  
2205:2219  
2206:2218  
2207:2217  
2208:2216  
2209:2215  
22462246:2258  
2247:2257  
2248:2256  
2249:2255  
22592259:2281  
2260:2280  
2261:2279  
2262:2278  
2263:2277  
2264:2276  
22822282:2427B 
22832283:2325K 
22842284:2384  
2285:2383  
22902290:2342  
2291:2341  
2292:2340  
2293:2339  
2294:2338  
2295:2337  
22962296:2322  
2297:2321  
2299:2317  
2300:2316  
2301:2315  
2302:2314  
2303:2313  
2304:2312  
23232323:2332  
2324:2331  
23262326:2389K 
2328:2387K 
2329:2386K 
2330:2385K 
23472347:2370  
2348:2369  
2349:2368  
2350:2367  
2351:2366B 
2352:2365B 
2353:2364  
2354:2363  
2355:2362  
23592359:2428K 
23722372:2381  
2373:2380  
2374:2379  
23952395:2421  
2396:2420  
2397:2419  
2398:2418  
2399:2417  
2400:2416  
2401:2415  
2403:2414  
2404:2413  
24552455:2496  
2456:2495  
2457:2494  
2459:2493  
2460:2490  
2461:2489  
2462:2488  
2463:2487  
2464:2486  
2465:2485  
2466:2484  
2470:2480  
2471:2479  
25072507:2582B 
2508:2580  
2509:2579  
2510:2578  
2511:2577  
2512:2574B 
2513:2571  
2514:2570  
2515:2569  
2516:2568  
2517:2567  
25202520:2545  
2521:2544  
2523:2540  
2524:2539  
2525:2538  
2526:2537  
2527:2536  
2528:2535  
25472547:2561  
2548:2560  
2549:2559  
2550:2558  
2551:2557  
25882588:2606  
2589:2605  
2590:2604  
2591:2603  
2592:2601  
2593:2600  
2594:2599  
26262626:2777K 
26302630:2788  
2631:2787  
2632:2786  
2633:2785  
2634:2784  
2635:2783  
2636:2782  
2637:2781  
26402640:2774  
2641:2773  
2642:2772  
2643:2771  
26462646:2674  
2647:2673  
2648:2672  
2649:2671  
2650:2670  
2651:2669  
2652:2668  
26752675:2732B 
2676:2731  
2677:2730  
2678:2729  
2679:2728  
2680:2727  
2684:2725  
2685:2724  
2686:2723  
2691:2718  
2692:2717  
2693:2716  
2694:2715  
2695:2714  
2696:2711  
2697:2710  
2698:2709  
2699:2708  
2700:2707  
2701:2706  
27352735:2769  
2736:2768  
2737:2767  
2742:2762  
2743:2761  
2744:2760  
2745:2759  
2746:2758  
27912791:2805  
2792:2804  
2793:2803  
2794:2802  
2795:2801  
2796:2800  
28082808:2891B 
2811:2889  
2812:2888  
2813:2887B 
2814:2886B 
28152815:2831  
2816:2830  
2817:2829  
2818:2828  
2819:2827  
28362836:2882  
2837:2881  
2838:2880  
2839:2878  
2840:2877  
2841:2876  
2842:2875  
2843:2874  
2844:2872B 
2845:2871B 
2846:2870  
2849:2866B 
2852:2865  
2853:2864  
2854:2863  
2855:2862  
2856:2861