23S rRNA Tentative Base Pair Frequencies for Helical Element 1933


 
Base Pair (1933 : 1967) (Tertiary)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 39.9 -- 0.1* 0.1 59.5* -- -- -- -- -- -- 0.2 -- -- -- -- 0.1 847
3 50.2* -- -- -- 49.5 -- -- -- -- -- -- 0.2* -- -- -- -- -- 436
B 91.2 -- -- -- 8.8 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 240
A -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 41
C 99.0 -- -- -- 1.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 101
E -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 154
M 6.1 -- 0.3* 0.3 92.6* -- -- -- -- -- -- 0.3 -- -- -- -- 0.3 310
 

 
Base Pair (1934 : 1964) (Tertiary)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 99.2* 0.2* -- -- -- -- -- 0.1 0.1 0.1 -- -- 0.1 -- -- 0.1 844
3 -- 99.3* 0.2* -- -- -- -- -- -- 0.2 0.2 -- -- -- -- -- -- 436
B -- 99.2* 0.4* -- -- -- -- -- -- 0.4 -- -- -- -- -- -- -- 240
A -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 41
C -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 101
E -- 99.4 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.6 -- -- -- -- -- -- 154
M -- 98.7* 0.3* -- -- -- -- -- 0.3 -- -- -- -- 0.3 -- -- 0.3 307


Last generated: Sat Oct 16 11:41:28 1999