23S rRNA Tentative Base Pair Frequencies for Helical Element 2028


 
Base Pair (2028 : 2614) (Tertiary)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 18.0* 0.3* 79.1* -- 0.4 -- 0.1 -- -- 1.0 -- -- -- -- 0.7 0.3 0.1 726
3 31.8* 0.5* 65.0* -- 0.7 -- 0.2 -- -- 1.2 -- -- -- -- -- 0.2 0.2 412
B -- -- 99.2 -- -- -- 0.4 -- -- 0.4 -- -- -- -- -- -- -- 236
A -- 4.9* 82.9* -- -- -- -- -- -- 9.8 -- -- -- -- -- 2.4 -- 41
C -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 52
E 97.0 -- -- -- 2.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.7 134
M -- -- 96.9 -- -- -- -- -- -- 0.8 -- -- -- -- 1.9 0.4 -- 262
 

 
Base Pair (2033 : 2613) (Tertiary)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- -- 80.9* 0.4 -- -- -- -- -- -- -- 18.6* -- -- -- 0.1 726
3 -- -- -- 66.7* 0.2 -- -- -- -- -- -- -- 32.8* -- -- -- 0.2 412
B -- -- -- 99.6 0.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 236
A -- -- -- 97.6 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.4 41
C -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 52
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- 134
M -- -- -- 99.2 0.8 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 262


Last generated: Sat Oct 16 11:41:28 1999