23S rRNA Tentative Base Pair Frequencies for Helical Element 2447


 
Base Pair (2447 : 2504) (Tertiary)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.1 -- -- -- 97.1* -- -- 0.4* -- -- -- -- -- -- -- 0.1 1.3 827
3 -- -- -- -- 97.4* -- -- 0.7* -- -- -- -- -- -- -- -- 1.9 420
B -- -- -- -- 96.7 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 3.3 241
A -- -- -- -- 92.7* -- -- 7.3* -- -- -- -- -- -- -- -- -- 41
C -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 101
E -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 137
M 2.9 -- -- -- 95.8 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.3 1.0 306
 

 
Base Pair (2453 : 2499) (Tertiary)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.1 -- -- 1.1 -- -- 2.3 79.0* -- -- 0.4 -- -- -- -- 17.1* -- 829
3 0.2 -- -- -- -- -- 3.3 62.0* -- -- 0.7 -- -- -- -- 33.7* -- 421
B 0.4 -- -- -- -- -- -- 99.6 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 242
A -- -- -- -- -- -- 34.1 48.8* -- -- 7.3 -- -- -- -- 9.8* -- 41
C -- -- -- -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 102
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 -- 137
M -- -- -- 2.9 -- -- 1.6 95.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 306
 
Base Pair (2454 : 2498) (Tertiary)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 98.8* -- -- 1.1* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.1 829
3 99.8 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.2 421
B 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 242
A 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 41
C 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 102
E 99.3 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.7 137
M 97.1* -- -- 2.9* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 306


Last generated: Sat Oct 16 11:41:29 1999