5S rRNA Tentative Base Pair Frequencies for Helical Element 35


Base Pair (35:86)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
3 -- 3.1 2.5 1.0 -- *59.2 0.8 *1.6 3.9 -- 0.5 *0.5 -- 0.3 5.1 1.5 20.0 611
B -- 5.3 1.0 -- -- *36.0 -- -- 4.0 -- *1.0 1.0 -- 0.7 6.6 1.3 43.2 303
A -- -- -- 13.6 -- -- 6.8 *22.7 11.4 -- -- -- -- -- 18.2 *11.4 15.9 44
E -- 2.0 4.4 -- -- *88.6 *0.7 -- 3.0 -- -- -- -- 0.3 1.0 -- -- 298
 
Base Pair (36:85)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
3 -- *57.9 -- -- -- 5.7 -- -- 1.3 2.9 16.5 3.4 -- 0.2 *1.3 0.2 10.5 611
B -- *26.5 -- -- -- 11.3 -- -- 2.3 3.3 24.8 5.0 -- 0.3 *2.6 0.3 23.5 302
A -- 40.9 -- -- -- -- -- -- -- 11.4 25.0 9.1 -- -- -- -- 13.6 44
E -- 89.9 -- -- -- 0.3 -- -- 0.7 1.3 6.4 1.3 -- -- -- -- -- 298
 
Base Pair (37:84)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
3 -- *46.2 *13.9 -- -- 3.9 0.8 *0.2 1.0 11.0 6.9 9.2 -- 0.2 0.8 0.8 5.1 610
B -- *42.1 0.3 -- -- 0.3 *1.7 0.3 1.7 9.3 13.6 18.2 -- 0.3 *0.7 0.7 10.9 302
A -- *43.2 2.3 -- -- 22.7 -- -- 2.3 2.3 -- 2.3 -- -- 4.5 *6.8 13.6 44
E -- *51.5 *28.3 -- -- 4.4 -- -- -- 13.8 0.3 1.3 -- -- 0.3 -- -- 297
 
Base Pair (38:83)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
3 -- *74.0 *0.3 -- -- 0.3 -- -- -- 15.2 6.1 1.5 0.2 0.3 -- -- 2.1 611
B -- *66.6 *0.7 -- -- 0.7 -- -- -- 17.9 6.0 3.0 0.3 0.3 -- -- 4.6 302
A -- 27.3 -- -- -- -- -- -- -- 54.5 13.6 4.5 -- -- -- -- -- 44
E -- 87.6 -- -- -- -- -- -- -- 6.0 5.4 0.3 -- 0.3 -- -- 0.3 298


Last modified on Thu May 21 09:51:27 1998 using program web_freq.