5S rRNA Tentative Base Pair Frequencies for Helical Element 39


Base Pair (39:46)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
3 0.2 -- 2.3 0.7 *37.0 -- *57.7 1.0 -- 0.2 -- -- 0.8 -- *0.2 -- -- 610
B -- -- 4.3 -- *0.3 -- *93.4 1.7 -- -- -- -- 0.3 -- -- -- -- 303
A 2.3 -- 2.3 9.1 *18.2 -- *63.6 -- -- 2.3 -- -- 2.3 -- -- -- -- 44
E 0.3 -- 0.7 -- *75.4 -- *21.9 0.3 -- -- -- -- 1.0 -- *0.3 -- -- 297
 
Base Pair (40:45)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
3 -- -- 93.1 -- -- -- 0.2 -- -- 0.3 -- -- 0.2 -- 6.2 -- -- 610
B -- -- 99.0 -- -- -- 0.3 -- -- 0.7 -- -- -- -- -- -- -- 303
A -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 44
E -- -- 86.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.3 -- 13.1 -- -- 297
 
Base Pair (41:44)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
3 -- 24.2 -- -- -- 19.0 -- -- 2.6 -- -- -- -- 8.7 -- -- 45.5 611
B -- 43.6 -- -- -- 32.7 -- -- 5.9 -- -- -- -- 17.8 -- -- -- 303
A -- 47.7 -- -- -- 47.7 -- -- -- -- -- -- -- 2.3 -- -- 2.3 44
E -- 3.0 -- -- -- 0.7 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 96.3 298


Last modified on Thu May 21 09:48:47 1998 using program web_freq.