5S rRNA Tentative Base Pair Frequencies for Helical Element 9-A


Base Pair (9:37)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
3 *74.4 -- -- *0.3 19.2 -- -- 2.1 0.2 -- 0.5 0.2 2.0 -- 0.5 -- 0.7 610
B *86.4 -- -- -- 2.6 -- -- 3.3 *0.3 -- 0.7 -- 3.6 -- 1.3 -- 1.7 302
A 59.1 -- -- -- 36.4 -- -- 2.3 -- -- -- -- 2.3 -- -- -- -- 44
E *65.0 -- -- *0.7 32.3 -- -- 0.7 -- -- 0.3 0.3 -- -- 0.7 -- -- 294
 
Base Pair (10:36)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
3 *54.2 -- *0.2 *5.7 1.5 -- 0.8 27.8 -- -- 1.6 0.2 0.5 0.2 3.6 0.2 3.6 611
B *37.4 -- 0.3 *11.6 3.0 -- 1.7 32.1 -- *0.3 2.0 0.3 1.0 0.3 2.0 0.3 7.6 302
A 95.5 -- -- -- -- -- -- 2.3 -- -- -- -- -- -- -- -- 2.3 44
E *63.1 -- -- -- 0.3 -- *0.3 28.5 -- -- 1.4 -- 0.3 -- 6.1 -- -- 295
 
Base Pair (11:35)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
3 -- 0.3 *1.5 0.2 0.5 -- -- -- -- 6.2 4.1 *63.3 0.3 -- 0.7 22.9 -- 611
B -- 0.7 *2.0 1.0 1.0 -- -- -- -- 2.6 7.3 *55.1 0.7 -- 1.3 27.7 0.7 303
A -- -- 9.1 -- -- -- -- -- -- *50.0 -- 11.4 -- -- -- *29.5 -- 44
E -- 0.3 *0.3 -- -- -- -- -- -- 3.4 2.0 *76.6 -- -- -- 17.3 -- 295


Last modified on Thu May 21 09:48:47 1998 using program web_freq.