5S rRNA Tentative Base Pair Frequencies for Helical Element 9-B


Base Pair (9:41)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
3 *23.4 *0.2 -- *0.8 17.0 -- 0.3 0.8 -- -- -- 0.2 2.3 8.5 -- 0.3 46.2 611
B *41.6 *0.3 *0.3 *1.7 28.7 -- 0.7 1.3 -- -- -- 0.3 5.0 17.5 0.3 0.7 1.7 303
A 45.5 -- -- -- *47.7 -- -- *2.3 -- -- -- -- -- 2.3 -- -- 2.3 44
E 3.1 -- -- -- 0.7 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 96.3 295
 
Base Pair (10:40)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
3 0.3 -- -- 34.4 *55.9 -- -- -- *0.2 -- -- 2.6 0.2 -- -- 6.2 0.2 610
B *0.7 -- -- *45.9 40.9 -- -- -- -- -- -- 4.3 0.3 -- -- 7.6 0.3 303
A -- -- -- 2.3 95.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.3 44
E -- -- -- 28.6 *63.6 -- -- -- *0.3 -- -- 1.4 -- -- -- 6.1 -- 294
 
Base Pair (11:39)
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
3 -- 35.2 21.3 -- -- *2.8 0.2 -- -- *37.0 0.2 1.5 0.8 -- -- 1.0 -- 610
B -- 0.3 28.7 -- -- 0.3 1.0 -- -- *63.4 -- 2.3 1.7 -- -- *2.0 0.3 303
A -- 6.8 22.7 -- -- *15.9 -- -- -- *50.0 2.3 2.3 -- -- -- -- -- 44
E -- *73.5 *14.6 -- -- 3.1 -- -- -- 7.8 -- 1.0 -- -- -- -- -- 294


Last modified on Thu May 21 09:51:27 1998 using program web_freq.