Base Pair (139 : 164) (Tertiary) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 82 |
B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4* | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4* | -- | 97.1 | 69 |
C | 56.1* | -- | 0.7* | -- | 0.3 | 0.3 | 0.3 | -- | 40.3* | -- | -- | -- | 1.0 | 0.7 | -- | -- | 0.3 | 303 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 30 |
Base Pair (140 : 163) (Tertiary) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 82 |
B | 1.4* | -- | 1.4 | -- | -- | -- | 1.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 95.7 | 69 |
C | -- | 56.4* | 1.7* | -- | 0.3* | -- | 0.3 | -- | 39.9 | -- | 0.3 | -- | -- | 0.7 | -- | -- | 0.3 | 303 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 97.8 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
Base Pair (141 : 162) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 98.8 | 82 |
B | -- | -- | -- | 1.4* | -- | 1.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | 95.7 | 69 |
C | 30.4 | 8.6* | 5.0* | 7.6 | 37.0* | 1.0 | 3.6 | 2.3* | -- | -- | 0.7 | 0.3 | 1.0 | 0.7 | -- | 1.3 | 0.7 | 303 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 97.8 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
Base Pair (142 : 161) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 98.8 | 82 |
B | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | 1.4* | -- | -- | -- | -- | 1.4* | -- | -- | -- | -- | 95.7 | 69 |
C | 3.0* | 38.3* | 26.4* | 1.7* | 1.7 | 1.0 | -- | -- | 2.0 | -- | 0.3 | 0.3 | -- | 4.3 | -- | 0.3 | 20.8 | 303 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | 97.8 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
Base Pair (143 : 160) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 98.8 | 82 |
B | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | 1.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4* | 95.7 | 69 |
C | 9.2* | 54.8* | 8.6* | 9.2* | 1.3 | 8.3 | 0.7 | 0.7 | -- | -- | 1.3 | 5.0 | -- | 0.3 | -- | 0.3 | 0.3 | 303 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 97.8 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
Base Pair (144 : 159) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 97.6 | 82 |
B | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | 2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 95.7 | 69 |
C | 12.9* | 36.1* | 8.9* | 13.9* | 3.6 | 8.9 | -- | 2.3 | 3.3 | 1.3 | -- | -- | -- | 0.3 | 0.7 | 2.6 | 5.0 | 302 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | 97.8 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
Base Pair (145 : 158) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 97.6 | 82 |
B | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 95.7 | 69 |
C | 8.9* | 22.1* | 17.2* | 3.6* | 7.3 | 5.0 | 0.3 | 0.7 | 1.0 | -- | 1.0 | 1.0 | 5.3 | 1.0 | 0.7 | 1.0 | 24.1 | 303 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 97.8 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
Base Pair (146 : 157) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2* | -- | -- | -- | -- | 1.2* | 97.6 | 82 |
B | -- | -- | -- | -- | 1.4* | -- | 2.9* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 95.7 | 69 |
C | 23.1* | 17.8* | 6.9* | 12.9* | 2.6 | 1.7 | 0.7 | 0.3 | -- | -- | 2.0 | 2.0 | 0.3 | 0.3 | 2.3 | 2.3 | 24.8 | 303 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 97.8 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
Base Pair (147 : 156) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 97.6 | 82 |
B | -- | -- | 4.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 95.7 | 69 |
C | 29.7* | 6.6* | 8.3* | 16.5* | 7.3 | 4.0 | -- | 0.3 | -- | 0.3 | 0.3 | -- | 0.7 | 0.3 | -- | 1.3 | 24.4 | 303 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 97.8 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
Base Pair (148 : 155) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 97.6 | 82 |
B | -- | -- | -- | 2.9* | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 95.7 | 69 |
C | 8.3* | 24.4* | 25.7* | 3.3* | 3.6 | 7.3 | -- | -- | 0.3 | -- | 0.7 | 0.3 | 0.3 | 1.0 | 0.7 | 1.3 | 22.8 | 303 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 97.8 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
Base Pair (149 : 154) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | -- | -- | 2.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 97.6 | 82 |
B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.9* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4* | 95.7 | 69 |
C | 38.0* | 22.1* | 3.0* | 4.3* | 0.3 | 6.6 | 0.3 | 0.3 | -- | 0.3 | 0.3 | 0.3 | -- | -- | 0.3 | -- | 23.8 | 303 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 97.8 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
Last generated: Mon Sep 20 12:28:08 1999