Group I Intron RNA Base Pair Frequencies for Helical Element 165


 
Base Pair (165 : 175)   Get: Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
A -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 82
B -- -- 1.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 98.6 69
C 15.5 53.1* 0.7* 1.7 24.1* -- 0.3 -- -- -- -- -- 4.0 -- -- -- 0.7 303
Z -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 124
D -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 17
E -- -- -- 2.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 97.8 46
U -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 31
 
Base Pair (166 : 174)   Get: Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
A -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 82
B -- -- -- 1.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 98.6 69
C 5.0* 50.0* 31.1* 5.6* 0.3 6.3 -- -- -- 0.3 0.3 -- -- -- -- 0.3 0.7 302
Z -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 124
D -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 17
E -- -- -- 2.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 97.8 46
U -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 31
 
Base Pair (167 : 173)   Get: Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
A -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 82
B -- -- -- -- -- -- 1.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 98.6 69
C 29.2* 22.6* 10.0* 24.3* 5.6 3.0 -- 3.3 -- -- -- -- 0.3 0.7 -- -- 1.0 301
Z -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 124
D -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 17
E -- -- -- 2.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 97.8 46
U -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 31


Last generated: Mon Sep 20 12:28:08 1999