Base Pair (215 : 258) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | 18.3 | -- | -- | 1.2 | 80.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82 |
B | 63.8* | -- | 2.9* | 7.2* | 21.7 | -- | -- | 4.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 69 |
C | -- | -- | 5.6* | 0.7 | 92.1* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.7 | -- | 302 |
Z | -- | -- | -- | 2.4 | 97.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
D | 11.8* | 76.5* | 5.9* | -- | -- | 5.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
E | 71.7* | -- | -- | 2.2* | 26.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
U | 6.5 | 29.0* | -- | 3.2 | 48.4* | -- | -- | -- | -- | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 9.7 | 31 |
Base Pair (216 : 257) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | 15.9* | 81.7* | 2.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82 |
B | 79.7* | 5.8* | 1.4* | 7.2* | 2.9 | -- | -- | 2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 69 |
C | 18.5* | 80.5* | -- | 0.3* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | 303 |
Z | 0.8* | 98.4* | -- | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
D | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
E | -- | 13.0* | 4.3* | -- | 82.6* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
U | 9.7* | 71.0* | 6.5* | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 9.7 | 31 |
Base Pair (220 : 253) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | 15.9* | 56.1* | 18.3* | 6.1* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | 2.4 | 82 |
B | 11.6* | 46.4* | 13.0* | 11.6* | 5.8 | 1.4 | -- | 1.4 | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | 1.4 | 5.8 | 69 |
C | 3.6 | 59.9* | 7.0* | 5.0 | 19.2* | 0.3 | -- | -- | -- | 2.0 | -- | 0.3 | 1.7 | -- | -- | 0.3 | 0.7 | 302 |
Z | 0.8* | 17.7* | 4.0* | 74.2* | 2.4 | -- | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | 97.8* | -- | -- | 2.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
U | 12.9* | 6.5* | -- | 9.7* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 71.0 | 31 |
Base Pair (221 : 252) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | 2.4* | 8.5* | 70.7* | 12.2* | 1.2 | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.7 | 82 |
B | 4.3* | 39.1* | 27.5* | 17.4* | -- | 2.9 | 1.4 | -- | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | 5.8 | 69 |
C | 17.9* | 33.1* | 37.1* | 7.3* | 0.7 | 1.3 | -- | -- | -- | 0.7 | 0.7 | 0.3 | -- | -- | -- | 1.0 | -- | 302 |
Z | -- | 17.7* | 79.8* | -- | 1.6* | -- | -- | 0.8* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | -- | 75.6* | 17.8* | -- | -- | 4.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | 45 |
U | -- | 3.2* | 9.7* | 12.9* | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 71.0 | 31 |
Base Pair (222 : 251) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | 3.7* | 11.0* | 74.4* | 7.3* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.7 | 82 |
B | 1.4* | 8.7* | 29.0* | 31.9* | -- | 2.9 | 10.1 | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | 13.0 | 69 |
C | 7.3* | 74.5* | 7.3* | 2.3* | 1.0 | 2.6 | -- | 1.0 | 0.3 | 1.0 | 0.7 | -- | 0.7 | 0.3 | -- | 0.7 | 0.3 | 302 |
Z | 4.8* | 83.9* | 0.8* | 5.6* | 0.8 | 0.8 | 0.8 | -- | -- | 0.8 | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.8 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | 4.3* | 47.8* | 39.1* | 2.2* | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | 2.2 | 46 |
U | 12.9* | 6.5* | -- | -- | -- | 3.2 | 3.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.2 | -- | 71.0 | 31 |
Base Pair (223 : 250) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | 8.5* | 11.0* | 9.8* | 58.5* | 2.4 | 1.2 | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 6.1 | 82 |
B | 7.2* | 8.7* | 27.5* | 26.1* | 4.3 | 1.4 | 1.4 | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 21.7 | 69 |
C | 0.7* | 65.7* | 2.6* | 3.0* | 0.3 | 2.3 | -- | -- | 1.7 | -- | 0.3 | -- | -- | -- | 0.3 | -- | 23.1 | 303 |
Z | 1.6* | 71.0* | 4.0* | 4.0* | -- | 3.2 | 0.8 | -- | -- | 1.6 | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | 12.9 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | 4.3 | 23.9* | 37.0* | 2.2 | 10.9* | -- | -- | -- | -- | 4.3 | -- | -- | 2.2 | 6.5 | -- | 2.2 | 6.5 | 46 |
U | -- | 16.1* | -- | 6.5* | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.2* | -- | 71.0 | 31 |
Base Pair (227 : 247) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | -- | 1.2 | -- | 1.2* | 2.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 95.1 | 82 |
B | 1.4* | 1.4* | 2.9* | 7.2* | -- | 2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 84.1 | 69 |
C | 8.3 | 11.3* | 15.2* | 7.0 | 29.5* | 0.7 | 0.7 | 2.3* | -- | 1.0 | 1.3 | 1.0 | 3.3 | 0.3 | -- | 0.7 | 17.5 | 302 |
Z | 6.5* | -- | 0.8* | 4.0* | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 87.9 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 46 |
U | -- | -- | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.8 | 31 |
Base Pair (228 : 246) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | 1.2* | 1.2* | -- | 2.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 95.1 | 82 |
B | 2.9* | 4.3* | 2.9* | 5.8* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 84.1 | 69 |
C | 37.7* | 13.6* | 14.6* | 10.3* | 3.0 | 2.0 | 0.3 | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 0.3 | 0.3 | 1.0 | 0.3 | 16.2 | 302 |
Z | 6.5* | -- | -- | 4.8* | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 87.9 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 46 |
U | 3.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.7 | 30 |
Base Pair (229 : 245) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | 1.2* | 3.7* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 95.1 | 82 |
B | -- | 4.3* | 2.9* | 7.2* | -- | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 84.1 | 69 |
C | 13.6* | 32.1* | 10.3* | 12.6* | 3.3 | 3.3 | 0.7 | 1.3 | 0.3 | 0.7 | 1.0 | 0.7 | -- | 0.3 | 0.3 | 0.7 | 18.9 | 302 |
Z | 0.8* | 1.6* | 5.6* | 0.8* | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 90.3 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 46 |
U | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.8 | 31 |
Base Pair (230 : 244) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.4 | -- | -- | -- | -- | 96.3 | 82 |
B | -- | 2.9* | 4.3* | 7.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | 84.1 | 69 |
C | 13.6* | 25.5* | 7.0* | 12.3* | 2.3 | 6.6 | -- | 0.7 | -- | 1.7 | 0.3 | 0.7 | -- | 0.3 | 0.7 | 2.0 | 26.5 | 302 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 99.2 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 46 |
U | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.8 | 31 |
Base Pair (231 : 243) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | 1.2* | -- | 2.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.3 | 82 |
B | -- | 1.4* | 4.3* | 7.2* | -- | -- | -- | -- | -- | 2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 84.1 | 69 |
C | 4.6* | 15.2* | 10.3* | 15.2* | 4.6 | 4.0 | 1.0 | 0.7 | 0.3 | 0.7 | -- | 0.3 | -- | 1.0 | 0.3 | 0.7 | 41.1 | 302 |
Z | -- | -- | -- | 0.8 | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 98.4 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
Base Pair (232 : 242) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | 1.2* | -- | -- | 2.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.3 | 82 |
B | -- | 1.4* | 1.4* | 7.2* | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | 87.0 | 69 |
C | 9.3* | 15.2* | 7.9* | 6.6* | 1.7 | 3.6 | -- | 1.3 | 0.7 | 0.3 | -- | 0.7 | 1.0 | 0.7 | 1.0 | 0.7 | 49.3 | 302 |
Z | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | 1.6 | 1.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
Base Pair (233 : 241) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | -- | 1.2* | -- | 2.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.3 | 82 |
B | -- | -- | 1.4* | 5.8* | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | -- | 89.9 | 69 |
C | 4.6* | 8.3* | 4.6* | 7.9* | -- | 2.3 | 0.7 | -- | -- | 0.3 | 1.3 | 1.0 | -- | 1.7 | -- | -- | 67.2 | 302 |
Z | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.6* | -- | 1.6* | -- | 96.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
Base Pair (234 : 240) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
A | 1.2* | -- | -- | 2.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.3 | 82 |
B | 2.9* | 1.4* | -- | 2.9* | -- | -- | 1.4 | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 89.9 | 69 |
C | 4.3* | 5.6* | 4.0* | 0.3* | 1.7 | 1.3 | -- | -- | 0.7 | 0.7 | 0.7 | 0.3 | -- | 0.7 | 0.7 | 0.7 | 78.5 | 302 |
Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.8* | 0.8 | 2.4* | 96.0 | 124 |
D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 46 |
U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
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